IMPDH基因克隆、生物信息学分析及在牦牛卵巢不同时期中的差异表达

2017-07-18 11:26:39熊显荣兰道亮胡嘉嘉字向东
西北农业学报 2017年6期

熊显荣,兰道亮,胡嘉嘉,李 键,字向东

(1.西南民族大学 生命科学与技术学院,成都 610041; 2.西南民族大学 青藏高原研究院,成都 610041)

IMPDH基因克隆、生物信息学分析及在牦牛卵巢不同时期中的差异表达

熊显荣1,兰道亮2,胡嘉嘉1,李 键1,字向东1

(1.西南民族大学 生命科学与技术学院,成都 610041; 2.西南民族大学 青藏高原研究院,成都 610041)

旨在获得牦牛IMPDH基因序列并进行生物信息学分析,同时分析其在卵巢组织中的时序表达谱,为进一步研究卵巢生长发育及排卵机制奠定基础。通过RT-PCR技术克隆牦牛的IMPDH基因,并运用生物信息学方法分析不同物种序列进化关系,利用荧光定量qRT-PCR技术检测IMPDH基因在不同发育时期牦牛卵巢组织中的表达情况。结果显示,克隆得到牦牛1 623 bp 的IMPDH基因cDNA 序列,内含1 545 bp开放阅读框序列,编码514个氨基酸残基。与野牦牛的相应序列具有很高的同源性(99.4%),表明IMPDH基因在进化过程中相对保守。实时定量RT-PCR检测结果显示IMPDH基因的表达随年龄的增加而呈现上升趋势。荧光定量qRT-PCR检测结果显示IMPDH基因在卵巢卵泡期表达最强,显著高于红体形成期。结果表明IMPDH参与牦牛卵巢组织的生长发育,并在卵巢活动中有明显的表达规律,表明IMPDH基因在牦牛繁殖周期具有重要作用,为进一步研究牦牛IMPDH基因功能奠定基础。

牦牛;克隆;IMPDH;序列分析;差异表达

牦牛(Bosgrunniens) 是一个特有且珍贵的畜种,主要分布于青藏高原及其毗邻地区,中国约占世界牦牛总数的95%[1]。在长期的人工选择和自然选择作用下,牦牛对高寒草地生态环境具有较强的适应能力,能在严寒、低氧、强紫外线辐射的恶劣环境条件下生存和繁衍后代,成为当地牧民赖以生存的生产和生活资料,也是主要经济来源之一[2]。……

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