DNA条形码鉴定研究

2017-08-07 07:48张仕林沈开文
关键词:条形码药材引物

刘 莉、张仕林、杨 飞*、沈开文、王 迅

(贵州汉方药业贵州省贵阳市,贵州 贵阳 550000)

DNA条形码鉴定研究

刘 莉、张仕林、杨 飞*、沈开文、王 迅

(贵州汉方药业贵州省贵阳市,贵州 贵阳 550000)

目的 探究应用DNA条形码对大黄类药物分类的效果。方法 提取四川、甘肃、青海、西藏、云南、宁夏6省份的40份样品叶绿体matK基因序列进行PCR扩增,将不同产地大黄的matK基因进行对比,以进行鉴定工作。结果 将提取的基因序列进过严格仔细的对比,能够发现40类样品中细微的差别。结论 通过DNA条形测序工作可以对大黄进行明确的品种分类。

大黄;matK基因

大黄有非常实用的临床药效,在中医临床中有广泛的应用,其主要的功效为泻下攻积、清热泻火、凉血解毒、逐瘀通经、利湿退黄等。正品大黄为蓼科大黄属的唐古特大黄、掌叶大黄或者药用大黄的根茎。近年来随着需求量的增大,以及野生大黄数量的急剧下降,在药材市场流通有大量的假冒伪劣产品。中药材的鉴别一直是一个热门的话题,人们长期寻找一种准确的鉴别方法。以前大多数是经有经验的药师通过外观、气味等方面进行鉴别。这就有非常的主观性,准确率比较低。今年来随着基因学的发展,人们通过对大黄基因学的研究,发现可以通过DNA序列的对比,可以对大黄进行准确的鉴别和分类。

1 资料与方法

1.1一般资料

选取产自四川、甘肃、青海、西藏、云南和宁夏6个省份的40份样品进行鉴定。这些样本经过专家鉴定为大黄,并保存相应的样本以备查验。

1.2 方法

从大黄药材根部中间部位选取20 mg,放入研磨器材中,加入液氮经过充分的研磨成粉状。然后用广谱植物基因提取试剂盒提取DNA,提取过程中进行充分的水浴,加入AP3缓冲液后高速离心1 min抽取上清液。将得到的DNA在-20℃的环境下保存待用。

用上海生工生物工程技术有限公司生产的由日本研发的3对引物,将目的基因进行PCR的扩增。引物信息以及退火温度详见表一。反应体系的构成:灭菌ddH2O 30 μL,10×Buffer 5 μL,2.5 mmol/L MgCl24 μL,dNTP4μL,引物各2 μL,DNA 模板2 μL,TaqDNA 聚合酶lμL。按照预先设计好的扩增程序进行PCR扩增。具体步骤为95℃预变性5 min;94℃变性30 s,50℃退火50 s,72℃延伸1 min,总共进行35个循环。将扩增的结果进行琼脂糖凝胶电泳检测后,送到上海生工生物工程技术有限公司进行测序[1]。

2 结 果

将所得的序列结果与文献中提供的序列进行分析对比,将序列100%相同的归为同一个基因组,有任何不同的视为不同基因型。某些样品经过PCR扩增后检测不到DNA,这可能是因为提取样品纯度不够,杂质过多影响了引物和相应基因的结合所导致。对于未检测到DNA的样品进行进一步的纯化后,再进过相同的流程得出了满意的结果。经过基因学分析大黄的matK基因序列全长在1518 bp~1524 bp之间,总共发现57个变异点,各个品种间有显著差异的特异位点区分。所有大黄的平均遗传距离为0.0421,最大遗传距离为0.4521,最小遗传距离为0.0036[2]。

表1 本研究中所用PCR引物的基本资料

3 讨 论

中药材由于炮制过程以及纯度的问题使得DNA的提取难度增大,有些研究中采用对ITS基因的扩增进行基因序列的研究,但是ITS除了大黄外,在一些真菌中的含量也十分的丰富。中药材中常含有不同程度的真菌,因此该基因序列检测的准确度大大降低。而本文中所采用的matK基因就很好的避免了这个问题,使检测的准确性以及可靠性大幅度的增加。本文中的检测样品量还不是十分充足,因此应进一步的研究,以便达到更好的鉴定效果。

[1] 李美妮,韩蕊莲,等.大黄与易混伪品土大黄、虎杖原植物的ITS2序列鉴定[J].环球中医药,2012,5(3):185-189.

[2] 张晓芹,刘春生,等.多基原药材大黄叶绿体matK基因序列分析及鉴定研究[J].药学学报,2013,48(11):1722-1728.

本文编辑:李 豆

[Q37]

B

ISSN.2095-6681.2017.08.72.01

科学技术部重大新药创制专项子课题(2014ZX09301308-007):苗药芪胶升白胶囊技术改造及再评价研究,负责人:刘 莉。贵阳国家高新区科技计划项目(合同编号:GXKH2015-20):芪胶升白胶囊处方药材DNA条码的建立项目

杨 飞,执业药师,主要研究方向:中药学。

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