刘晶,王俊杰,程璐,陈利青,禾璐,候蕊,韩渊怀,*
(1.山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801; 2.山西农业大学 生物工程研究所,山西 太谷 030801;3.山西省农业科学院玉米研究所,山西 忻州 034000; 4.山西省晋城市城区农业委员会,山西 晋城 048400)
谷子Aux/IAA家族基因干旱胁迫响应表达模式分析
刘晶1,王俊杰2,程璐1,陈利青1,禾璐3,候蕊4,韩渊怀1,2*
(1.山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801; 2.山西农业大学 生物工程研究所,山西 太谷 030801;3.山西省农业科学院玉米研究所,山西 忻州 034000; 4.山西省晋城市城区农业委员会,山西 晋城 048400)
[目的]Aux/IAA是重要的蛋白质转录因子,广泛参与植物生长素介导的应答作用,同时参与植物的胁迫和防御响应。本文通过分析Aux/IAA家族基因在干旱胁迫中的表达情况,探索谷子抗旱与Aux/IAA家族基因的关系。[方法]本文对谷子Aux/IAA家族基因理化性质、蛋白亲疏水性、启动子功能元件等进行生物信息学分析,并对抗旱(GG)和干旱敏感(JF16)谷子品种在浇水和干旱胁迫下基因的表达谱数据进行分析。[结果]谷子Aux/IAA家族基因均含有多个与胁迫相关的功能元件,且5个基因编码的蛋白均为亲水性蛋白;干旱胁迫处理后,GG和JF16中5个基因的表达变化趋势有所不同,Seita.5G126200、Seita.1G028400、Seita.3G109400表达量均下调,Seita.1G356800基因的表达量明显上调。[结论]谷子Aux/IAA家族基因参与调控谷子干旱胁迫,其调控过程比较复杂,可作为参与谷子抗旱的候选基因。本研究结果为进一步探究谷子中Aux/IAA与抗旱机制提供一定理论依据。
谷子;Aux/IAA; 干旱胁迫; 生物信息学分析
谷子(Setariaitalica(L.)Beauv.),在古代被称做“百谷之长”,是我国种植最古老的农作物之一,是重要的杂粮作物[1]。……