谷子SnRK2家族基因的生物信息分析许

冰霞，尹美强*，李娜，温银元，赵娟，原向阳，宋喜娥，董淑琦

(1.山西农业大学 农学院，山西 太谷 030801； 2.山西潞安智华农林科技有限公司，山西 襄垣 046204)



谷子SnRK2家族基因的生物信息分析许

冰霞1，尹美强1*，李娜2，温银元1，赵娟1，原向阳1，宋喜娥1，董淑琦1

(1.山西农业大学 农学院，山西 太谷 030801； 2.山西潞安智华农林科技有限公司，山西 襄垣 046204)

[目的]植物SnRK2是一类蔗糖非酵解型蛋白激酶，在信号转导和非生物胁迫及生长发育中具有非常重要的作用。[方法]本文利用生物信息学的方法从谷子基因组中分析鉴定出10个SnRK2基因，并对这些基因的染色体分布、理化性质、内含子-外显子结构、系统进化和顺式调控元件进行了分析。[结果]谷子的SnRK2基因分布在基因组中不同的染色体上，外显子数目大多为9个。这些基因被分为3个亚组，且与拟南芥和水稻的分类一致。而且，这些基因的上游启动子序列含有多个不同的激素和非生物逆境应答顺式元件，这说明它们在逆境应答和激素信号转导中具有一定的功能。[结论]本文为进一步研究谷子SnRK2基因在非生物胁迫和激素应答中的作用奠定了基础。

谷子；SnRK2； 生物信息学分析

SnRK蛋白激酶家族是一类广泛存在的蔗糖非酵解型蛋白激酶，被分为SnRK1、SnRK2和SnRK3三个亚族[1]，其中的SnRK2是一类仅存在于植物中的蛋白激酶。许多的研究报道，SnRK2家族基因在ABA信号转导[2]、非生物胁迫[3]、气孔关闭以及生长发育过程[4～15]中具有重要作用。例如小麦TaSnRK2.8可以作为一种调节因子参与到干旱、盐和低温多种胁迫反应中[4]；……