滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析

2017-08-11 23:12:02张晓东李彩霞刘倩倩王元忠王家金
西南农业学报 2017年7期
关键词:分析

张晓东,李彩霞,李 爽,刘倩倩,王元忠,王家金*

(1.玉溪师范学院资源环境学院,云南 玉溪 653100;2.云南省农业科学院药用植物研究所,云南 昆明 650223)



滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析

张晓东1,李彩霞1,李 爽1,刘倩倩1,王元忠2,王家金2*

(1.玉溪师范学院资源环境学院,云南 玉溪 653100;2.云南省农业科学院药用植物研究所,云南 昆明 650223)

【目的】克隆滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因GrG10H(geraniol 10-hydroxylase),分析其生物信息学特征、基因结构、蛋白表达和组织表达情况,为龙胆苦苷生物合成途径解析提供理论依据。【方法】通过RT-PCR及基因克隆方法,从滇龙胆总RNA中克隆得到基因GrG10H及其基因组序列;使用生物信息学方法分析其DNA序列及其编码蛋白特性,使用Clustal X2.1软件对GrG10H蛋白质及其同源序列做序列比对,使用MEGA7.0软件进行系统发育树构建;利用定量PCR技术分析GrG10H基因在滇龙胆根茎叶中的表达水平。【结果】使用RT-PCR方法从滇龙胆叶片中克隆得GrG10H基因全长为1834 bp,包含2外显子和1内含子,ORF 1548 bp,将序列提交至GenBank,得到序列号KJ418410。生物信息学分析表明,该基因编码515个氨基酸,分子量为57.74 kD,理论等电点为9.02;该蛋白属于细胞色素P450超家族成员,定位于内质网,其N端含一跨膜螺旋(21~43),其中1~20氨基酸残基位于膜内,44~515位于膜外。该蛋白无信号肽,为亲水稳定蛋白,主要由无规则卷曲(44.85%)和α-螺旋(40.58%)构成。GrG10H蛋白与川西獐牙菜SmG10H蛋白具有较高的相似性(87%),且亲缘关系最近。原核表达结果表明,GrG10H基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为83.74 kD (含GST标签26.00 kD),与预期蛋白大小一致。组织特异性表达分析结果表明GrG10H基因主要在叶中表达。……

登录APP查看全文

猜你喜欢
分析
禽大肠杆菌病的分析、诊断和防治
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
电力系统不平衡分析
电子制作(2018年18期)2018-11-14 01:48:24
电力系统及其自动化发展趋势分析
经济危机下的均衡与非均衡分析
对计划生育必要性以及其贯彻实施的分析
现代农业(2016年5期)2016-02-28 18:42:46
GB/T 7714-2015 与GB/T 7714-2005对比分析
出版与印刷(2016年3期)2016-02-02 01:20:11
网购中不良现象分析与应对
中西医结合治疗抑郁症100例分析
伪造有价证券罪立法比较分析