猪流行性腹泻病毒 ORF3基因的克隆及序列分析

易华山，毕俊萱，马鲜平，唐明霞，张德志，王芝英

(西南大学 荣昌校区动物医学系，重庆 402460)



猪流行性腹泻病毒 ORF3基因的克隆及序列分析

易华山，毕俊萱，马鲜平，唐明霞，张德志，王芝英

(西南大学 荣昌校区动物医学系，重庆 402460)

为研究2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场是否有猪流行性腹泻病毒的感染与流行，对猪流行性腹泻病毒 ORF3(Open reading flame 3)基因进行克隆及序列分析研究。通过从疑似流行性腹泻病毒感染的猪场采集小肠组织，采用RT-PCR方法对猪流行性腹泻病毒的 ORF3基因进行克隆。结果表明，所获得的 ORF3基因ORF长675bp，编码223个氨基酸。通过DNAMAN软件分析，表明本研究中克隆的 ORF3基因与CV777标准株(AF353511)的 ORF3基因相似性为96.45%，与中国的NJ(KJ642645)的相似性最高，为99.41%，与attenuated DR13疫苗株(EU054930)相似性90.52%，而与CV777疫苗株(GU372744)相似性仅79.07%。系统进化树分析表明，该基因与中国毒株、韩国毒株以及美国分离株USA/ Illinois 201/2014 (KR265795)处于同一进化分支上，而attenuated DR13疫苗株、CV777 truncated疫苗株和欧洲的CV777标准株处于另一个进化分支上，说明该基因与中国毒株、韩国毒株的遗传距离最近。通过 B细胞抗原表位预测分析，发现其氨基酸第65～68、114～116、137～140和150～154区域可能有潜在的优势抗原表位。成功克隆了猪流行性腹泻病毒 ORF3 基因，说明2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场存在猪流行性腹泻病毒的感染。

猪流行性腹泻病毒； ORF3基因；序列分析

猪流行性腹泻( porcine epidemic diarrhea，PED)是由猪流行性腹泻病毒( porcine epidemic diarrhea virus，PEDV)引起的一种急性接触性肠道传染病[1]。PED是世界范围内发生与流行的猪病之一，1971年在英国首次被报道；此后，在多个国家和地区相继报道PED，如比利时、中国、韩国等[2-4]。……