滇皖产区铁皮石斛居群SSR分子身份证的构建△

董晓曼，袁媛，查良平，彭代银，俞年军，王继永，赵玉洋，蒋超，黄璐琦

(1.道地药材国家重点实验室培育基地，中国中医科学院 中药资源中心，北京 100700；2.安徽中医药大学 药学院，安徽 合肥 230012；3.安徽省中医药科学院 中药资源保护与开发研究所，安徽 合肥 230012；4.中国中药公司，北京 100195)

·基础研究·

滇皖产区铁皮石斛居群SSR分子身份证的构建△

董晓曼1，2，袁媛1*，查良平2，3，彭代银2，3，俞年军2，王继永4，赵玉洋1，蒋超1*，黄璐琦1

(1.道地药材国家重点实验室培育基地，中国中医科学院 中药资源中心，北京 100700；2.安徽中医药大学 药学院，安徽 合肥 230012；3.安徽省中医药科学院 中药资源保护与开发研究所，安徽 合肥 230012；4.中国中药公司，北京 100195)

目的：建立滇皖产区铁皮石斛SSR指纹图谱，并构建不同居群的SSR分子身份证。方法：使用生物信息学方法分析铁皮石斛(Dendrobiumofficinale)全基因组SSR(Simple sequence repeat)序列，获得SSR位点，使用Primer Premier 5.0软件设计引物并进行PCR扩增，选择高多态性引物进行遗传多样性分析并建立SSR指纹图谱代码，使用二维码生成器表述铁皮石斛居群的分子身份证。结果：共获得91 653个SSR位点，平均分布距离为15.44 kb。据此开发了75对SSR引物，筛选出32对多态性丰富、带型清晰的引物，对11个滇、皖产区的铁皮石斛居群进行遗传多样性分析，共得到117个多态信息位点，平均每个SSR引物多态信息含量(PIC)为0.62，变化范围为0.22～0.80；铁皮石斛不同居群进行亲缘关系聚类表明11个铁皮石斛居群可分为三支，与种质来源分布相一致。筛选出4对多态性高、带型清晰易于统计的引物组合，建立不同居群铁皮石斛的SSR指纹图谱库和不同居群的分子身份证。……