几种稳定构型精氨酸分子的手性转变反应机理及水溶剂化效应

2017-10-13 03:30:07汤德怀喻小继杨晓翠王佐成
复旦学报(自然科学版) 2017年3期

汤德怀,喻小继,杨晓翠,王佐成,佟 华

(1. 白城师范学院 计算机科学学院,白城 137000;2. 长春师范大学 外语学院,长春 131000;3. 白城师范学院 物理学院,白城 137000)

几种稳定构型精氨酸分子的手性转变反应机理及水溶剂化效应

汤德怀1,喻小继2,杨晓翠3,王佐成3,佟 华3

(1. 白城师范学院 计算机科学学院,白城 137000;2. 长春师范大学 外语学院,长春 131000;3. 白城师范学院 物理学院,白城 137000)

采用密度泛函理论的B3LYP方法、微扰理论的MP2方法和自洽反应场(SCRF)理论的smd模型方法,研究了2种最稳定构型的精氨酸分子的手性转变机理及水溶剂化效应.研究发现标题反应有3条通道a、b和c.对于构型1,分别是手性碳上的质子以氨基、羰基和氨基联合以及羧基和氨基联合为桥迁移.对于构型2,分别是手性碳上的质子只以氨基为桥、羧基异构后再以氨基为桥迁移及以羧基和氨基联合作桥迁移.势能面计算表明: 构型1的主反应通道都是a,决速步自由能垒分别为268.2kJ·mol-1,来源于质子从手性碳向氨基氮迁移的过渡态.构型2的主反应通道是b,决速步自由能垒为239.3kJ·mol-1,来源于质子从手性碳向氨基氮迁移的过渡态.水溶剂效应使构型2的主反应通道决速步自由能垒降到95.7kJ·mol-1.结果表明: 随着温度的升高,构型2先手性转变;水溶剂对精氨酸的手性转变有极好的催化作用.

精氨酸; 手性; 密度泛函理论; 过渡态; 微扰理论; 自洽反应场

精氨酸(Arg)是一种人体必需氨基酸,分为左旋体(S-Arg)和右旋体(R-Arg).S-Arg具有重要的生理、代谢和营养作用.S-Arg参与一些与氮转移、贮……

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