董永军 ,王陆军 ,郝建平 ,王艳梅 ,李培良 ,王创云 ,邓艳芳 ,周 琼 ,李志敏,庞 冰,张婷婷
玉米干种子基因组DNA提取方法的改进
董永军1,王陆军2,3,郝建平1,王艳梅2,3,李培良2,3,王创云2,3,邓艳芳3,周 琼3,李志敏3,庞 冰1,张婷婷1
(1.山西大学生命科学学院,山西太原030006;2.山西省农业科学院作物科学研究所,山西太原030031;3.山西省玉米工程技术研究中心,山西太原030031)
为了实现玉米干种子基因组DNA快速提取,针对玉米干种子淀粉含量高的特点,对传统核酸CTAB提取方法进行了优化与改良,将提取的DNA进行分光光度计及琼脂糖凝胶电泳检测。结果显示,DNA的OD260/OD280值为1.79~1.95,OD260/OD230值为1.90~2.15;琼脂糖凝胶电泳图谱清晰,条带无拖尾现象,说明采用改良方法提取的DNA质量高、无降解。以改良方法提取的DNA样品作为模板进行分子标记检测试验,结果清晰稳定,进一步证明采用改良CTAB法直接从玉米干种子中提取的DNA可以满足SSR和SNP等分子试验的要求。
玉米;干种子;DNA;CTAB
近年来,随着分子育种技术的发展与应用,玉米育种进程显著加快,分子育种越来越受到广大研究者的青睐。提取高质量的核酸是进行玉米分子育种研究的基础,核酸的质量对下游分子试验的影响至关重要。
目前,常用来提取植物基因组DNA的方法有CTAB 法[1-3]、SDS 法[4-5]、酶法[6]和高盐提取法[7]等。其中,CTAB法仍被许多实验室用来提取玉米基因组DNA,提取材料一部分是玉米嫩叶,提取DNA时需要进行发芽、液氮研磨,费时费力;另一部分是玉米干种子,提取周期长,质量欠佳。分子育种研究的样品材料多数为干种子,而其中含有大量的多糖、淀粉、蛋白质等物质[8],如何快速有效地去除这些物质,从玉米干种子中提取到高质量的基因组DNA,是分子育种研究的关键技术。……