环状RNA在猪中的研究进展

乔木+程碧军+付晶+武华玉+吴俊静+刘贵生+梅书棋+彭先文

摘要：环状RNA（circular RNA，circRNA）对基因的表达有重要调控作用，综述了circRNA的特征、形成机制及生物学功能，并对近年circRNA在猪中的研究进展进行了归纳总结。

关键词：环状RNA；分子特征；生物学功能

中图分类号：S828；Q78 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2017）24-4685-03

环状RNA（circular RNA，circRNA）呈闭合环状，是一类不具有5′末端帽子和3′末端尾巴的特殊内源性非编码RNA，是目前RNA研究领域的新热点，普遍存在于人、鼠、猕猴、猪等各类动物体内[1-5]。研究发现circRNA在转录本中实际上所占比例相当大，一些基因的circRNA表达量至少是其线性转录本的10倍[1]。近年来的研究显示，circRNA在生物的发育进程中发挥了重要的生物学功能，同时对于基因表达也具有重要调控作用，包括对其亲本基因及与之结合miRNA的靶基因调控。环状RNA在生物体内非常稳定，在疾病的发生与发展过程中也扮演着重要角色，这使circRNA的研究具有重大意义。

1 环状RNA的发现

1976年，Sanger等[2]利用电镜首先在植物感染的类病毒（Viroids）中发现了这些以共价键形成的闭合环状单链RNA分子。1990年，首次在真菌细胞中发现其踪迹，Matsumoto等[6]在酿酒酵母中发现20S RNA没有自由的5′端和3′端，通过电镜觀察发现是呈环形的RNA分子。随后发现从肿瘤抑制基因DCC、人Ets-1基因以及小鼠Sry基因中转录而来的环状RNA[7-9]。尽管在真核细胞中早已发现了circRNA的存在，但却被视为一种由外显子转录发生剪接错误而未能引起科学家的关注[9]。

随着RNA测序（RNA sequencing，RNA-seq）技术的发展及生物信息技术的更新和完善，使生物学家们累积了大量的RNA序列数据，其中一些来自无尾巴的RNA，于是circRNA的研究成为新热点[1]。……