利用GSS高通量测序技术分析不同生境下霍山石斛内生真菌群落的分布

张培良，王国凯，梁益敏，马宗慧，刘海涛，韩 婧，吴 娟，王 刚

(安徽中医药大学药学院 现代中药安徽省重点实验室，安徽 合肥 230012)

植物内生真菌是指在植物的部分或全部生长史中，生活在健康植物组织和细胞间，但又不引起任何病症的真菌[1]。近年来，对内生真菌的研究提示，内生真菌具有促进宿主植物的生长以及增加宿主抵抗逆境的能力，甚至还能促进宿主活性成分的合成和积累[2-4]，这些内生真菌特殊的生物学特性表明内生真菌在药材的生长以及道地性形成中具有至关重要的作用[5]。此外，内生真菌还表现出生长区域专属性，即不同产地的同一种药材其内生真菌群落分布具有差异性[6]，这使得内生真菌成为研究药材道地性形成的重要因子。

霍山石斛(Dendrobiumhuoshanense)又称米斛，是安徽省道地药材。本研究以不同产地以及不同栽培方式下的霍山石斛为样本，运用DNA分子标记技术，在确定各样本均为霍山石斛(Dendrobiumhuoshanense)同属种的基础上，探讨在不同生境下霍山石斛内生真菌群落分布的特征性，以期能够从内生真菌角度，为建立新的药材道地性鉴别模式奠定科学基础。绿盾测序(Green Shield Sequencing，GSS)是由Illumina高通量测序技术改进的最新测序技术，其不仅具有高通量、高灵敏度、高准确性和低运行成本的特点，还可以从源头上消除宿主植物样本中叶绿体和线粒体序列带来的干扰，还原样本中微生物群体的真实比例。这为更全面地探讨霍山石斛内生真菌的分布提供了技术保障。……