SAT技术检测结核杆菌rRNA对肺结核的快速诊断价值

2018-05-17 11:30许蕴怡蔡杏珊谭耀驹刘燕文曾少芳马品云周辉林
实用医学杂志 2018年2期
关键词:敏感度肺结核阴性

许蕴怡 蔡杏珊 谭耀驹 刘燕文 曾少芳 马品云 周辉林

广州市胸科医院检验科(广州 510095)

中国的结核病流行趋势令人关注。目前能否提供敏感、快速的抗结核疗效指标指导临床应用,至关重要。目前,结核病的实验室检查中的涂片荧光染色镜检法及快速培养法(Bactec MGIT960)仍然是确诊肺结核的传统方法,临床监测疗效可通过以下指标来考察:(1)2个月直接涂片阴转率:现常用于结核病的控制指标,但耗时长,其在国内阳性率总体不高,仅为10%~30%[1],敏感度低;(2)快速培养法(Bactec MGIT960)比前者优越,但检测周期长,时间滞后于用药,而限制其临床应用;而两者阳性者均难以鉴别结核及非结核杆菌,前者不能区分死活菌。

近年来,分子技术在国内外发展以及临床广泛应用,以RNA为靶标的诊断技术可以反映病原体的存活状态,用于疗效监测。SAT⁃TB技术是以MTB特异的16srRNA为靶标实时检测,从而快速测出样本中是否有活MTB存在。本研究通过SAT⁃TB技术对结核病患者的痰、支冲液标本进行检测来判断MTB的活菌是否存在,评价其对肺结核病的快速诊断价值。

1 资料与方法

1.1 一般资料 选则广州市胸科医院收集2015年9月22日至11月22日广州市胸科医院疑似肺结核患者痰液169份、支冲液151份,共计320份标本;同时进行SAT法、快速培养法(Bactec MGIT960)检测。

1.2 主要试剂与仪器 试剂:结核分枝杆菌(TB)核酸检测试剂盒(上海仁度生物科技公司,批号20150925);荧光涂片法染色液及快速液体法培养液均由我院检验科自配;仪器:美国应用公司ABI7300荧光定量扩增仪;BACTEC MGIT960仪器。

1.3 方法

1.3.1 标本预处理 提取约2 mL左右的标本至50 mL离心管中,加1~2倍的2%N⁃乙酰半胱氨酸-氢氧化钠前处理液(去污染),漩涡震荡20 s,静置15 min后,以3 200 r/min离心15 min,弃去上清,加入1 mL/管PBS缓冲液(pH=6.8)以中和PH至6.8,混匀备用。

1.3.2 SAT⁃TB检测 取液化好的痰标本1 mL于EP管中,以13 000 r/min离心5 min,后弃上清,再加入1 mL PBS缓冲液重悬离心,弃上清。将痰液标本加入50 μL裂解液重悬,该样品即为待测样本,用超声破碎仪破碎15 min,功率300 W。后将2 μL处理物加入含30 μL扩增检测液的洁净微量反应管或者反应板中。置恒温荧光检测仪上进行检测。

1.3.3 快速液体培养法(Bactec MGIT960) 提取约2 mL左右的标本至50 mL离心管中,加1~2倍的2%N⁃乙酰半胱氨酸-氢氧化钠前处理液(去污染),漩涡震荡20 s,静置15 min后,以3 200 r/min离心15 min,弃去上清,加入1 mL/管PBS缓冲液(pH=6.8)以中和PH至6.8,取液化后的痰标本放入BACTEC MGIT960仪器检测。

1.4 统计学方法 采用SPSS 16.0统计软件进行统计学分析。分别以快速液体培养法和临床诊断为“金标准”,计算SAT检测的灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测值,突出比较BD960快速液体培养法和SAT法在痰液、支冲液的阳性检出率,“率”用卡方检验比较,P<0.05为差异具有统计学意义。

2 结果

2.1 一般资料 广州市胸科医院疑似肺结核患者的痰液169份、支冲液151份,共计320份标本进入最后研究。169例痰液标本患者中,男122例,女47例。痰液标本菌鉴结果为非结核分枝杆菌患者有8例,其中龟-脓肿分枝杆菌复合群3例,胞内分枝杆菌5例,3例非结核分枝杆菌感染患者的培养为阳性且SAT⁃TB为阴性。151例支冲液标本患者中,男97例,女54例。支冲标本菌鉴结果为非结核分枝杆菌患者有6例,其中龟-脓肿分支杆菌复合群3例,堪萨斯分枝杆菌2例,鸟-土分枝杆菌1例,2例非结核分枝杆菌感染患者的培养为阳性且SAT⁃TB为阴性。见表1、2。

表1 169例疑似肺结核患者痰液的BD960法与SAT法实验结果Tab.1 The result of 169 sputum suspected MTB patients of BD960 and SAT⁃TB 例

表2 151例疑似肺结核患者支冲液的BD960法与SAT⁃TB法实验结果Tab.2 The result of 151 BALF suspected MTB patients of BD960 and SAT⁃TB 例

2.2 以培养法为标准,SAT⁃TB检测痰液、支冲液诊断肺结核的价值 BD960快培法在痰液、支冲液的阳性检出率分别为:29.58%(50/169)和23.18%(35/151);SAT⁃TB法在痰液、支冲液的阳性检出率36.09%(61/169)和39.07%(59/151)。痰、支冲液两者的阳性率比较:痰SAT法阳性检出率较BD960快速培养法高6.51%,(χ2=59.34,P< 0.05);支冲液SAT法阳性检出率较BD960快速培养法高15.89%,(χ2=36.69,P<0.05),差异均有统计学意义。SAT⁃TB检测痰液、支冲液对肺结核患者的诊断价值见表3、4。

表3 SAT⁃TB检测痰液对肺结核患者的诊断价值Tab.3 The diagnostic value of testing sputum MTB patients by SAT⁃TB

表4 SAT⁃TB检测支冲液对肺结核患者的诊断价值Tab.4 The diagnostic value of testing BALF MTB patients by SAT⁃TB

2.3 以临床诊断为标准,SAT⁃TB检测痰液、支冲液诊断肺结核的价值 若以临床诊断作为判断肺结核为阳性标准,临床诊断肺结核包括培阳及培阴肺结核,临床诊断非肺结核或疑似肺结核为阴性标准,SAT法在痰液、支冲液标本对肺结核的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为:57.73%(56/97)、93.06%(67/72)、91.80%(56/61)、62.04%(67/108);51.82%(57/110)、94.29%(39/41)、96.61%(57/59)、42.39%(39/92);BD960法在痰液、支冲液标本的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为:51.55%(50/97)、95.83%(69/72)、94.34%(50/53)、59.48%(69/116);33.64%(37/110)、90.24%(37/41)、90.24%(37/41)、33.64%(37/110)。

3 讨论

多种结核杆菌的快速诊断方法均已建立,主要以DNA或者RNA作为检测靶标的分子生物学技术,有噬菌体快速诊断法、基因芯片法[2-4]等。目前,一种以RNA为标本类型的检测手段受到人们的关注,其原理是以MTB特异的16srRNA为检测目标,通过实时荧光定量PCR技术,快速判断MTB是否存在[5],又可反映是否存在活菌,优于直接涂片荧光法和BD960法,与前者比较,操作时间从1 d缩短到1.5 ~ 2 h[6];与后者比较,SAT⁃TB法检测痰液/支冲液操作完成总共时间平均为1.5~2 h,BD960快培法平均报阳时间约为14~21 d,检测时间上优于BD960法[6-10]。

现在常用荧光探针定量PCR技术与SAT⁃TB技术相比,均具有快速的优点。前者扩增产物为DNA无法做活菌诊断,更不能反映活菌的量,无法监测患者的用药疗效,不利于临床调整用药方案。并且DNA也较易在实验室中产生污染;后者则可弥补其不足。

本研究结果显示:BD960快培法和SAT法在痰液、支冲液的阳性检出率分别为:29.58%(50/169)和 23.18%(35/151)、36.09%(61/169)和37.75%(57/151)。痰标本两者的阳性率比较,SAT⁃TB法阳性检出率较BD960快速培养法高6.51%,差异有统计学意义(χ2=59.34,P< 0.05);支冲液两者的阳性率比较,SAT阳性检出率较BD960快速培养法高15.89%,“率”之间的比较,差异存在统计学意义(χ2=36.69,P<0.05)。SAT法在痰液、支冲液标本的敏感度分别为:84%(42/50);89%(33/37)。用 LE PALUD 等[11]用 Xpert Mtb/RIF检测BALF对培阳标本的敏感度为80%,特异度为98.6%;其他方法如KIM等[12]研究巢式PCR法诊断结核病的敏感度仅为69.4%。以IS6110为基础的环介导恒温扩增法(LAMP)[13]检测呼吸道标本诊断肺结核的敏感度可达89.6%。因此,与其他最新使用的分子生物学诊断技术比较,SAT⁃TB法检测BALF诊断结核病的敏感度与最新使用的其他分子生物学技术Xpert Mtb/RIF相似,比经典PCR法敏感度高。所以,SAT⁃TB法检测支冲液能提供较高的敏感度和特异度。

此外,在痰、支冲液中SAT⁃TB法检测结果与BD960法的一致率达81.66%、76.16%,也就是说SAT⁃TB法能够在最短的时间内提供准确率为81.66%或76.16%的诊断结果;SAT法在痰液、支冲液的阳性检出率36.09%、39.07%略高于BD960快培法29.58%、23.18%。

从数据中却不难发现,50例痰培阳标本中有8例SAT⁃TB法阴性,37例痰培阳标本中有4例SAT⁃TB阴性,说明产生假阴性结果,与BD960快速培养法比较痰、支冲液的SAT⁃TB法的检出率分别为84%、89%,而非100%,而痰中14例、支冲液中24例却被SAT⁃TB法检出阳性。因此,若以临床诊断肺结核为计算肺结核阳性标准,临床上仍有约10%~20%的培阳患者无法通过SAT⁃TB法检出,但结果证明SAT⁃TB法对肺结核的检出率略高于BD960快速培养法。两者存在各自的优点,究其原因可能有:(1)SAT⁃TB法的靶标为RNA,它降解的速度快,对于菌量未足的标本会因处理时间过长,RNA降解后而不被检出,这与操作者控制试验的时间至关重要。而BD960快速培养法中不存在RNA降解的问题,只是在固定时间范围内达到一定的菌量即可在液体培养基生长。因此,因不同操作者而得出的不同的阳性检出率。(2)当患者可能是结核杆菌与非结核杆菌感染混合感染时,会干扰SAT⁃TB法对结核杆菌的检出,而培养法可以为阳性。因此,BD960快速培养法与SAT⁃TB法可以同时用于临床辅助诊断,但本研究证明:SAT⁃TB法检测痰液和支冲液标本中的结核分枝杆菌,具有快速、敏感度高、特异度和阳性率较好的优点,可区分结核和非结核杆菌。因此,SAT⁃TB法为一项有价值的辅助临床诊断的工具之一。

综上所述,该技术的今后临床使用中,若能增加患者的标本量或在用药的不同时段增加该项目的检测,对药物治疗的跟踪监测具有非常重要的意义,这是单纯依靠BD960快速培养法在此方面是无法比拟的;若能把SAT⁃TB法联合BD960法一起使用,可能会进一步提高检测的敏感度。因此,SAT⁃TB法技术在临床上是值得广泛推广应用的。

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