糜子Ty1-copia型反转录转座子基因的序列特征及表达分析

何杰丽，薛延桃，王瑞云,*，陈国荣，陈凌，王海岗，杨美红*，乔治军*

(1.山西农业大学 文理学院，山西 太谷 030801；2.山西农业大学 农学院，山西 太谷 030801；3.山西省农业科学院 农作物品种资源研究所/农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室，山西 太原 030031)

糜子(PanicummiliaceumL.)，属禾本科黍属，抗逆性强，是干旱半干旱地区主粮作物[1、2]。反转录转座子是植物基因组中普遍存在的一类遗传因子，以DNA-RNA-DNA的转座机制在植物基因组中移动，从而影响基因组变化和基因表达[3]。根据功能不同植物中反转录转座子包括两大类，长末端重复序列(LTRs，long terminal repeats)和非长末端重复序列(non-LTRs，no-long terminal repeats)[4]。Non-LTR包括PLE类型(PLE)、DIRS类型(DIRS)、短散布重复序列(SINE，short interspersed repetitive element)以及长散布重复序列(LINE，long interspersed repetitive element)[5]；LTR包括Ty1-copia和Ty3-gypsy两种类型[6]，含3个基因，分别为聚合酶基因(pol)、特异抗原基因(gag)、整合酶基因(int)。Ty1-copia和Ty3-gypsy两类反转录转座子结构和功能相似，主要区别为pol基因区域中INT基因插入的位置不同。一般情况下反转录转座子由于缺失、移框和终止子等原因，不能形成反转录转座子蛋白，不具生物学活性，呈静止状态。病毒、细菌、真菌病原接种[7～9]以及水杨酸、茉莉酸甲酯[10]等生物和非生物胁迫后，不活跃的LTR在植物受到转录激活。在生物和非生物胁迫下，植物反转录转座子被激活以参与调节抗逆相关基因表达，反转录转座的发生可能与植物自我防卫反应有关，是植物保护自我的反应机制[11]。

糜子中参与干旱胁迫应答的相关基因有很多[12～14]，但关于糜子Ty1-copia基因是否参与干旱胁迫应答、其表达特性如何尚未见报道。……