乳腺癌中c-MYC调节的剪接基因鉴定及其临床意义分析△

张永明，王一澎，马飞

国家癌症中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院1教育处，2乳腺外科，3肿瘤内科，北京100021

RNA剪接是指从DNA模版链转录出的初级转录本中去除内含子，并将外显子拼接在一起，产生成熟的信使RNA的过程。对于具有多个外显子的基因而言，剪接过程产生了具有不同外显子组成方式的信使RNA，并被翻译成不同的蛋白产物，极大地丰富了基因组编码蛋白的多样性，对维持细胞的正常功能以及决定细胞和组织的特异性发挥着重要作用。RNA剪接过程调控紊乱与肿瘤及多种疾病有关。如在肿瘤的发生、发展过程中，肿瘤相关基因的调控序列在剪接位点常发生基因突变，从而影响基因的选择性剪接过程。剪接复合体核心组分的蛋白表达异常影响了剪接体的正常功能，与肿瘤的进展和转移有关[1]。MYC癌蛋白是大多数人类肿瘤的主要驱动因子，MYC可以结合到基因组中的活性调控元件上，广泛扩大基因表达，导致细胞不受限制地生长[2]。MYC开启一组与剪接体组成元件相关的基因表达，剪接相关基因对MYC驱动肿瘤形成起到至关重要的作用[3-4]。本研究通过分析乳腺癌多组学数据，鉴定MYC调控的剪接基因，并评价其潜在的预后价值，为深入研究MYC在乳腺癌中的作用机制，鉴定潜在的乳腺癌治疗靶点提供理论依据。

1 资料与方法

1.1 数据库分析

利用癌症和肿瘤基因图谱（cancer genome atlas，TCGA）数据库调取乳腺癌数据集BreastⅠnvasive Carcinoma（TCGA，Provisional）数据，分析乳腺癌中与c-MYC共表达的基因；采用DAVⅠD（functional annotation bioinformatics microarray analysis）数据库对c-MYC共表达的基因进行功能富集分析；……