利用可变窗口FST方法检测不同尾型呼伦贝尔羊尾部脂肪沉积相关基因

2018-08-07 11:44:28张统雨樊红樱朱才业刘家鑫邓天宇杜立新王立贤赵福平
畜牧兽医学报 2018年7期
关键词:信号检测

张统雨,樊红樱,朱才业,刘家鑫,邓天宇,杜立新,王立贤,赵福平

(中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193)

中国地方绵羊品种根据尾型分为5类:长脂尾、短脂尾、短瘦尾、长瘦尾和脂臀尾[1]。将脂肪沉积在尾部这是绵羊独有的特性。尾部脂肪在逆境条件下(如寒冷等)提供身体能量所需,类似于骆驼的驼峰,属于适应性性状[2]。但是随着肥胖、心脑血管以及糖尿病的增加,人们更倾向于高蛋白和低脂肪的肉类[3]。另外,从饲养成本来看,生产1 kg脂肪所消耗的饲料可产生2 kg瘦肉[4],因此,尾脂沉积过多不利于产生经济效益。

不同尾型的绵羊品种是通过长期的人工选择和自然选择形成的,而选择也会在基因组上留下烙印,这就是选择信号(selection signature,SS)[5]。目前,选择信号检测方法很多[6],其中对两个及多个群体进行选择信号检测时比较经典的方法就是FST[7],该方法也常应用于羊的选择信号检测中[3, 8-13]。在现有文献资料中,对肥瘦尾性状之间的选择信号检测时[3, 11-13],都是将不同品种的羊简单的按照尾型划分为肥、瘦尾两类,这样就很难消除不同遗传背景对检测结果的影响。其实在中国地方品种中,呼伦贝尔羊(属于短脂尾绵羊品种)群体内存在明显的尾部大小差异,主要是因为该品种内存在两个品系[14],这为同一个品种内不同品系开展选择信号检测提供了一个理想的动物资源。

本研究使用 Illumina Ovine 600K BeadChip 高密度SNP芯片,针对呼伦贝尔羊不同品系利用可变窗口FST进行选择信号检测。旨在挖掘呼伦贝尔羊尾部脂肪沉积的候选基因,揭示影响绵羊尾部脂肪沉积基因,为培育短尾绵羊品种提供理论依据。……

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