棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析

2019-01-23 12:05:08杨笑敏王俊娟王德龙陆许可陈修贵郭丽雪王帅陈超王晓歌韩明格叶武威
生物技术通报 2019年1期

杨笑敏 王俊娟 王德龙 陆许可 陈修贵 郭丽雪 王帅 陈超王晓歌 韩明格 叶武威

(中国农业科学院棉花研究所 棉花生物学国家重点实验室 农业部棉花遗传改良重点开放实验室,安阳 455000)

S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl methionine,SAM)在DNA甲基转移酶的催化下把甲基(-CH3)转移到DNA分子中特定碱基上的过程称为DNA甲基化的过程[1]。多数发生在CpG岛的胞嘧啶第5位碳原子(C5)上,通常发生在对称序列CG中,但是在CHG和CHH(H=A、C或T)序列中也有发生[2]。DNA甲基化是一种广泛存在的表观遗传过程,包括转座子的抑制、基因组印记[3]、X染色体失活[4]、细胞分化[5]和胚胎发育[6]。在胁迫条件下植物通过DNA甲基化过程,诱导一些与抗逆相关的基因表达,增强植物的抗逆性,维持植物的生长发育和进化过程[7]。DNA甲基化是一种植物响应逆境胁迫的分子机制[8]。植物中存在2种DNA甲基化方式:一种是维持甲基化(Maintenance methylation),通过半保留复制把双链DNA分子的一条链存在甲基化,另一条链没被甲基化的亲代甲基化模式传递给子代[9];另一种是从头甲基化(De novomethylation),通过不同的DNA甲基转移酶催化将不存在甲基化的DNA双链形成甲基化[10]。植物中的C5-DNA甲基转移酶有4种,维持DNA甲基转移酶(Methyltransferase,MET)家族[11];染色质甲基化酶(Chromomethylase,CMT)家族[12];Dnmt2;结构域重排甲基转移酶(Domains rearranged methyltransferase,DRM)家族可以在RNA指导下,催化胞嘧啶从头甲基化,以及维持非CpG位点的甲基化[13];MET、CMT与动物的DNMT1 为同源[14];DRM 与动物的 DNMT3 同源[15]。

非生物胁迫严重影响和制约着农作物的产量和品质。当烟草发生渗透胁迫时(NicotianaL.)组织培养细胞的异染色质区会发生DNA超甲基化[16]。CHROMOMETHYLASE3(SLCMT3)基因可以使Chr番茄果实的成熟,提高控制成熟关键基因的表达[17];……

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