基于生物信息学分析的卵巢癌微小RNA调控网络的初步构建

李丹丹，丁世家，陈维贤△

(1.重庆医科大学第二附属医院检验科，重庆 400010;2.重庆医科大学临床检验诊断学教育部重点实验室，重庆 400016)

卵巢癌是妇科最常见肿瘤之一，病死率极高、预后差，是女性健康的严重威胁之一[1]。由于卵巢癌没有特殊的预防措施，同时多数患者早期表现隐匿，不易引起重视，诊断明确往往已属晚期，失去治疗及手术最佳时期，临床提倡早发现、早治疗，因此，疾病发病机制的研究对早期诊断及防控具有重要的临床意义[2]。大量研究显示，卵巢癌的发生、发展受到多种基因的调控，微小RNA(miRNA)及长链非编码RNA(lncRNA)是两类重要的RNA，参与细胞生长的一系列重要进程，包括细胞增殖、分化、凋亡及死亡等过程，其在基因转录及翻译过程中调控具有极为重要的作用，在卵巢癌发生发展过程中，miRNA表达失调将导致细胞的过度增殖、过度分化，从而导致肿瘤的发生发展。由于miRNA介导的基因调控在卵巢癌中发病机制复杂，目前尚未完全阐明。鉴于将循证生物学信息分析和实验论证相结合，有利于从循证研究角度为miRNA、lncRNA及靶基因关联的进一步研究提供研究证据。本研究采用现代分析软件，在生物信息学分析基础上初步构建卵巢癌miRNA及匹配lncRNA调控网络，探讨miRNA在卵巢癌细胞中的分子调控机制，为卵巢癌的早期诊断、早期治疗提供有力的参考依据，现报道如下。

1 资料与方法

1.1资料来源 基因分析中常用的miRNA及lncRNA分析数据库：miRwalk 2.0数据库(网址：http://zmf.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk2/index.html)[3]；HMDD v2.0数据库(网址：http://www.cuilab.cn/hmdd)[4]；starBase v2.0(网址：http://starbase.sysu.edu.cn/)[5]；lncRNA 疾病数据库(网址：http://www.cuilab.cn/lncrnadisease)[6]。……