肺腺癌增强子调控miRNA前馈环路的识别与功能分析

2019-02-28 03:26:38李志学梁子涵贾承霖漆宇骋岳俊杰郭志云
生物技术通讯 2019年6期
关键词:肺癌数据库

李志学,梁子涵,贾承霖,漆宇骋,岳俊杰,郭志云

1.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都610031;2.军事科学院 军事医学研究院 生物工程研究所,北京100071

肺癌在世界范围的发病率和致死率都高居各类癌症之首,分别达11.6%和18.4%[1]。肺癌分为小细胞癌和非小细胞癌,非小细胞癌又分为鳞状细胞癌、腺细胞癌等亚型,其中肺腺癌最为常见。肺腺癌治疗方法主要包括手术、放疗、化疗和靶向治疗,但仅靠这些疗法还无法保证彻底治愈[2]。因此,关于肺腺癌发生发展分子机制及调控机理的研究,仍是学术界关注的热点。

在人类进化演变的过程中,形成了纷繁复杂又高度有序的基因网络调控结构,它们由一定的模序(motif)元件所构成,在生物体内发挥着重要的基因调节作用[3]。其中,前馈环路(feed-for⁃ward loops,FFLs)是一种重要的循环线性模序,它由2个输入调节因子P1和P2,以及1个输出因子P3 构成。P1 可以调节P2,也可以与P2 共同调节P3,即P3 所受到的网络调节的影响是P1、P2 元件综合作用的结果。

增强子是真核细胞中普遍存在的顺式调控元件,可以通过招募转录因子(transcription fac⁃tor,TF),进而结合多种激活因子,形成多蛋白复合物,使染色质成环,远端调控启动子。通过对增强子染色质的修饰和重塑等作用,促进基因的转录[4]。此外,较多证据表明,增强子与microRNA(miRNA)间同样存在复杂的调控关系。Xiao 等[5]通过删除HEK293T细胞系中的miR-24-1 增强子基因座,发现miR-24-1的表达量下降,其邻近基因不能再被激活,表明miR-24-1 邻近基因的转录激活依赖于完整增强子的存在。……

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