生物信息学创新教学模式的探究

2019-03-16 03:22尤琪
科技创新导报 2019年29期
关键词:实践方法生物信息学创新教学

尤琪

摘   要:伴随社会科技的不断发展,在人类基因组计划、遗传语言、生物大分子功能与结构等研究取得成果下,从20世纪80年代末开始生物信息学已经成为了生物科学中一门新兴学科,对各界人士在生物领域的工作研究有着重要作用。本次研究将对生物信息学基本概念、目前教学存在的问题进行分析,并提出了创新教学模式具体实践方法。

关键词:生物信息学  创新教学  实践方法

中图分类号:G642                                  文献标识码:A                        文章编号:1674-098X(2019)10(b)-0187-02

作为生物学科重要组成部分,生物信息学是生物学研究以及学习生物的科研人员、教师以及学生的重要工具。作为一门全新并具有极大发展潜力的前沿学科,生物信息学创设条件还不够成熟,在师资力量、教学模式以及教学方法等方面存在一定问题,制约着学生学习生物成效。因此,本文对生物信息学创新教学模式的研究,有十分重要的现实意义。

1  生物信息学基本概念

生物信息学作为一门新兴学科,主要是生物学、数学以及计算机科学之间进行相互结合发展而成。其主要是通过信息科学与计算机等方式,进而完成数据分析、数据处理,探索海量数据间内在关系以及生物学涵义,从而达到提炼具有价值生物学知识的目的[1]。

2  生物信息学教学现状

2.1 师资力量匮乏

师资力量是衡量一门学科发展水平的关键,而当前生物信息教学,没有一个完善的师资队伍,满足不了我国生物信息学发展需求,同时教师教学水平达不到生物信息学教学要求标准。

2.2 缺乏人才培养

在生物信息学专业人才培养方面,不同教师不同教学经验,对人才培养方式也不尽相同,导致生物课程体系不符合学生实际需求,从而直接影响学生实践能力和探究能力,很大程度上制约了我国当前综合能力人才的培养[2]。

2.3 欠缺学科互通

从目前学科设置上看,生物学科和其他专业缺乏有效的结合和互动。生物信息学科虽然是新兴学科,但是和其他学科之间仍然存在一定联系,不同学科教师之间缺乏相互交流和合作,使得生物教学现状不乐观。

2.4 教学理念陈旧

受传统教学观念根深蒂固影响,教师通常只是重视知识灌输,完成教学计划,缺乏对学生能力以及素质等方面的培养。值得注意的是,任何教学中都不能忽视理论与实践结合,否则单调的教学内容会使得学生失去学习兴趣,不利于培养学生实践能力。

2.5 教材配置不完善

所有教学都要依据教材进行,当今生物信息学教育快速发展,但是并不具备合适的理论和实验教材,现阶段主要应用的是国外原版教材以及翻译书籍,我国学者自行研究制定的书籍少之又少[3]。

3  生物信息学创新教学模式具体实践方法

3.1 明确生物信息学教学目标

在不同学科教学活动中,教师和学生角色定位就不同,在一些教学活动中,教师是主角,学生是配角,而有一些教学活动,二者角色就要相互转换,主要是依据教学内容,根据实际情况进行灵活掌握。生物信息学是多学科之间交叉而生的产物,涵盖内容较为复杂广泛,因此,如果让学生独立自主学习,会带来一定难度。特别是生物信息学中有关数学知识方面,如隐马尔科夫链、动态规划算法等等,在教学中需要教师做主导角色进行讲授。

由于课堂时间受限,利用探究式教学模式,让学生充分利用课余时间继续拓展知识。如玉米基因组SSR引物设计,对于这种问题,通常无法得到直接答案,需要学生自己查找相关数据库而后进行总结分析。然后对学生实行随机分组制,通过小组合作方式去搜索相关基因和蛋白质数据库。针对具体问题进行讨论,最后教师总结分析,对学生学习情况进行点评,并给出适当合理建议。

3.2 理论与实践充分结合

3.2.1 有效利用生物数据库,提高学生处理能力

生物信息学教师让学生利用生物数据库,提高学生对生物信息处理能力,在大型服务器和计算机参与下,大大提高了生物分子研究工作效率。目前,生物数据库总数已经达到500个以上,蛋白质以及其他生物大分子结构,蛋白质结构分类,数据库通过网络为其提供多种形式数据检索服务。

3.2.2 开发序列比对软件,增强学生动手能力

開发序列比对软件,可以增强学生利用生物信息处理软件能力。通过比较,把未知序列和数据库中已知数列进行对比,这是一种有效的研究方式。可以实现2个物种全基因组序列对比工作,进行序列比对比主要目标是通过判断2个序列之间是否有充足相关性,进而判断二者是否存在同源性关系。在实验教学中,通过培训序列比对软件开发,使得学生更好地使用生物信息处理软件,同时也能解决其他软件问题。

3.2.3 合理运用生物信息学,提高学生思考能力

教师在实践教学中结合相关生物信息学相关知识,增强学生思考能力,提高蛋白质信息获取能力。因为构成蛋白质的20种氨基酸化学构造上与构成核算的4种碱基差别相差甚远,所以无论是蛋白质结构还是功能,都具多样性。目前,对蛋白质结构信息获取工作还需耗费大量时间,对技术和技巧提出了更高要求。由于蛋白质结构和功能的复杂,需要通过生物信息学相关技术方法对其解释,充分利用生物信息学知识,促使学生更好更快掌握蛋白质信息。

3.2.4 利用网络平台,优化实验教学

当今是高技术信息时代,教师应当充分利用网络平台,发挥其优势,实现优化实验教学目的。所谓生物信息學实验教学,主要是通过对大量生物数据进行处理、分析出实际需求,进而培养学生运用生物信息学相关知识和方法,具有生物信息提取、存储、处理以及分析能力,促使学生形成独立思考和独立分析能力,并将理论知识运用到解决实际问题中。生物信息学教学应根据学生掌握情况逐渐增加难度,把典型的生物学问题进行实验设计,调动学生积极主动性和探索精神,激发学生学习能力以及创新能力。

生物信息学实验教学利用互动网平台,把计算机作为辅助工具,在计算机网络实验室内完成。把课程知识与网络有效结合,通过电子邮件与学生之间建立交流,将教学内容、工具等传递给学生,此外,学生也可通过这种方式将实验报告、作业以及各种问题和意见反馈给教师,利用网络时效性,实现了教师和学生相之间双赢的目的。

3.2.5 加强实践考核,强化学生综合能力

生物信息学主要目的是学习运用互联网。计算机以及其他应用软件,掌握分析生物信息理论和方法。因此,通过上机实际操作着重考核学生在互联网作用下,分析生物信息以及解释结果的能力,考察学生生物信息学基本知识和基本原理的掌握程度,同时也考核学生生物信息分析和实际应用能力。通过实践考核,进一步提升学生将理论用于实践中的综合能力。

4  结语

总而言之,生物信息学作为一门全新学科。教师要了解当前生物信息学现状,明确教学目标,以生物信息学知识为主体,充分将理论知识和实践教学结合。通过数据库的使用、开发序列比对软件、利用网络平台优化实验教学、加强实考核等方法,调动学生主观能动性,发挥探索精神,提高学生实际操作能力,进一步提升学生综合能力以及创新精神。

参考文献

[1] 朱柳村,李嘉睿.生物信息学创新教学模式的探究[J].安徽农学通报,2017(6):185-187.

[2] 胡杨.《生物信息学》课程教学模式探讨[J].生物信息学, 2018,16(2):10-13.

[3] 罗晓霞,夏占峰,王建明.生物信息学课程“教研一体化”教学模式初探[J].教育现代化,2017,4(52):57-59.

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