共表达网络分析揭示新型生物标志物在胃腺癌患者生存预后中的应用价值

鄢传经， 胡清林， 严 海， 徐成飞， 王 昊

成都医学院第一附属医院胃肠外科，四川 成都 610500

胃腺癌是常见的消化系统恶性肿瘤之一，位居世界上癌性死亡相关疾病的第二位[1]。改善早期诊断技术和治疗方法是延长患者生存期的关键，但目前治疗进展期的胃腺癌疗效仍然很差[2]。进展期胃腺癌常以淋巴结途径和血行转移，以及腹膜播散的方式而复发，结果严重影响患者的预后生存时间[3]。尽管一些非手术治疗手段得到了应用，但是目前手术治疗和/或化疗仍是胃腺癌治疗的主要手段。因此，迫切需要改善早期诊断技术及开发新型的生物治疗手段，以提高治疗效率、减少手术创伤、延长患者预后生存。

基因芯片技术是近年来非常流行的一种检测组织或细胞基因表达的方法，由于其准确度高、操作方便及信息含量丰富而广泛应用于全基因组转录和翻译的检测[4]。并且这项技术也被大量用于胃腺癌组织和正常组织间基因差异的比较[5-6]，从基因水平探索分子生物学变化在胃腺癌中的作用机制。因此，对大量信息的解读是了解疾病的重要步骤，也是用于发现新型生物标志物的重要过程。本研究即是对大量胃腺癌患者组织的基因芯片进行基因表达差异与共表达分析，探索用于诊断及患者预后生存时间分析的新型生物标志物。

1 材料与方法

1.1 基因芯片数据获取从国立癌症研究协会(National Cancer Institute，NCI)的基因组公共数据库(Genomic Data Commons，GDC)获取各个国家已经公开发布的胃腺癌患者的基因表达数据集，数据来源的病理组织类型限定为胃腺癌，芯片数据类型为RNA测序类型的芯片数据。……