应用生物信息学方法筛选结直肠癌关键基因

朱义芳,戴红梅,张峪涵,魏丹凤,潘逼然,刘 蕾,张彤彤，郭元彪，刘华伟△

(1.四川省骨科医院检验科，四川成都 610041；重庆医科大学附属成都第二临床学院/成都市第三人民医院:2.检验科；3.神经内科；4.实验医学研究部，四川成都 610031)

结直肠癌是第3位常见的恶性肿瘤，在全球肿瘤相关性死亡的原因中也位列第3位[1]。2018年美国结直肠癌新发病例数预计超过14万，死亡病例数超过5万[2]。结直肠癌发病机制复杂，包括多个基因、多条通路的交互作用[3]。到目前为止，结直肠癌仍是全球医疗的重大难题，仍缺乏系统的、整体的理解其发病的分子机制。传统的单基因检测的研究，虽然能发现某些基因在肿瘤形成发展中发挥的具体作用，但不能全面的挖掘出结直肠癌形成过程中更为广泛存在的多个基因和通路的改变。近年来，随着基因芯片技术在肿瘤中的广泛应用，大量的芯片数据产生，其中大部分数据被储存在公共数据库中未被挖掘。整合并重新分析这些数据可为新的研究提供线索，为全面分析结直肠发病的分子机制提供便利[4]。

本研究选取了4个GEO芯片数据集来鉴定结直肠癌中差异表达的基因，这些差异表达基因可作为潜在的结直肠癌标志物。进一步的功能富集分析可阐明这些差异表达基因的生物学功能，信号通路分析可明确它们调控结直肠癌的信号通路的关键分子，为揭示结直肠癌发病机制奠定基础。

1 材料与方法

1.1 芯片数据信息 从美国国立生物……