2017-2018年吉林部分地区规模化猪场猪细环病毒的遗传变异分析

刘东旭，李国江，苗丽娟，沙万里，尹柏双∗

（1.吉林农业科技学院，吉林吉林132101；2.预防兽医学吉林省重点实验室，吉林吉林132101）

猪细环病毒（Torque teno sus virus，TTSuV）是一种无囊膜、环状、单股负链DNA病毒，病毒粒子直径约 30 ～32 nm［1］。 人细环病毒（Torque teno virus，TTV）是由日本学者Nishizawa等在1997年使用代表性差异分析技术发现的一种新病毒。1999年，美国学者首次从猪血清中分离到该病毒后，已在中国、加拿大、日本等国家发现TTSuVs的流行［2］。 根据核苷酸序列差异，TTSuVs可分为TTSuVl和 TTSuV2两种基因型。其中 TTSuVl有4 种亚型，即 TTSuVla、TTSuVlb、TTSuVlc和 TSuVld。TTSuV2 有 四 种 亚 型，即 TTSuV2a、TTSuV2b、TTSuV2c和TTSuV2d［3］。该病毒编码区中包含3个开放阅读框（ORF1-ORF3），1个 TATA盒和1个PolyA。其中ORF1基因是编码衣壳蛋白和复制相关结构域的基因，不同毒株之间差异较大，可用于TTSuVs的分型鉴定。

吉林省虽是养猪大省，但到目前为止仍没有关于猪群TTSuVs遗传变异分析的报道。为此，本研究对2017-2018年吉林省猪生态养殖及疫病防控科技创新中心收集的574份血清样品进行检测，并对其部分毒株进行ORF1序列分析，了解吉林部分地区规模化猪场TTSuVs的基因特性，为进一步研究TTSuVs的遗传进化提供依据。

1 材料与方法

1.1 病料的收集 收集2017-2018年来自吉林地区10家规模化猪场的血清样品574份。猪场所在地分别为：长春市、吉林市、白城市、四平市、通话市、白山市、延吉市7个地区。同时记录每份样品的基本信息，包括猪的身体状况、年龄及品种等。

1.2 材料与试剂 UNIQ-10柱式病毒基因组抽提试剂盒购自上海生物工程技术服务有限公司；PCR克隆载体pMD18-T、感受态细胞JM109、蛋白酶K、DNA分子量标准DL2000、Taq酶、dNTP购自TaKaRa公司；DNA凝胶回收试剂盒、溴化乙锭（EB）、琼脂糖、琼脂粉购自维特杰公司。……