南沙海区深海沉积物中细菌多样性分析

2020-03-12 02:15:56明红霞陈泉睿张春鑫关道明樊景凤
生物学杂志 2020年1期

苏 洁,明红霞,陈泉睿,张春鑫,关道明,樊景凤

(1. 国家海洋环境监测中心,大连 116023; 2. 国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室,大连 116023; 3. 大连海洋大学 水产与生命学院,大连 116023)

深海是全球最大的独立系统,地球表面有超过50%的面积被深海大洋所覆盖[1]。深海沉积物是集化学物质和微生物于一体的特殊生态环境,同时海底沉积物还是营养元素进行生物地球化学循环的主要场所[2]。在深海沉积物中存在着活跃的微生物群落,负责介导有机碳的降解和转化,在海洋和全球碳的生物地球化学循环中起着重要的作用[3]。深海沉积物中的微生物总量在全球生物量的比重已超过10%[4]。研究深海微生物多样性不仅有利于开发利用新型微生物资源,也将为人类探索生命起源提供重要线索。随着大洋钻探计划(ODP)多个航次的进行,太平洋边缘海域沉积物中的细菌群落结构及其优势类群已被逐步发现[5-8]。然而,由于深海独特的环境特征如低温、高压、缺氧等,导致海底99%以上的微生物无法利用现有技术得到分离培养[9],这使得基于16S rDNA的分子生物技术成为调查海底沉积物中微生物多样性的一种重要手段。

目前,研究学者对南沙海区表层沉积物中细菌和古菌多样性有了一些初步的了解,但研究对象主要为可培养细菌[10-11]。鉴于南沙海区广阔的水域及其多变的生境,加之以往的研究还不能全面地反映南沙海区深海沉积物中细菌资源多样性,为探讨南沙海区深海沉积物中细菌多样性,本研究运用16S rDNA克隆文库的方法展开对南沙海区深海沉积物中细菌群落结构的研究。……

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