基于TCGA研究铁死亡相关基因对乳腺癌患者的预后

2020-04-13 03:10:42侯晨阳胡艳玲黄代政毛宇昂
广西大学学报(自然科学版) 2020年6期
关键词:乳腺癌分析模型

侯晨阳,胡艳玲,黄代政,毛宇昂

(广西医科大学 信息与管理学院,广西 南宁 530000)

0 引言

在全世界女性队列中,乳腺癌是最常见的恶性肿瘤之一,死亡率高居第二位,且发病率和死亡率一直逐年上升,对女性的健康有着极大的隐患[1]。在分子水平上,乳腺癌是一种具有高异质性的肿瘤,按照分子分型,乳腺癌分为四种亚型,即Luminal A型、Luminal B型、HER2过表达型、Basal-like型,且每一种亚型的乳腺癌患者的预后具有明显差异[2]。此外,世界各地不同的地理环境也造成了乳腺癌患者预后和总体生存率具有差异。由于乳腺癌病因复杂,加上高度的异质性,使得探究疾病预后成为一种挑战。另外,乳腺癌治疗手段的局限性的使然,开发新的预后模型成为一种必然。

铁死亡是一种铁依赖性的,区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自噬的新型的细胞程序性死亡方式,在致命的脂质过氧化驱动下,从而诱导细胞死亡[3-4]。近年来,相对于具有耐药性肿瘤的传统治疗方法,通过铁死亡机制,诱导肿瘤癌细胞死亡成为一种有前景的治疗手段。除了铁死亡的诱导因子外,许多基因也被确定为铁死亡的标志物。然而,这些和铁死亡相关的基因与乳腺癌患者预后的关系还尚不清楚。

在本研究中,首先从公共数据库下载了乳腺癌患者的mRNA表达谱及相应的临床数据。然后,在TCGA队列中通过铁死亡相关的差异表达基因构建了一个多基因预后模型,并在METABRIC队列中验证此模型。最后,笔者进一步进行了功能富集分析,以探讨其潜在的生物学机制。……

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