对抗病毒, “算”出的结构需实验验证

2020-04-13 09:58:52金凤
科学导报 2020年15期
关键词:钥匙结构实验

金凤

近日,人工智能公司DeepMind宣布,其用AlphaFold预测了六种由新冠病毒基因编码的蛋白质的三维结构,包括膜蛋白、非结构蛋白等,而且已经开放下载。

获悉病毒蛋白质结构

有助于研发针对性药物

病毒由核酸和蛋白质组成,而蛋白质是由病毒基因组编码的。病毒蛋白质有两种,一种是结构蛋白,它们可以构成一个形态成熟的有感染性的病毒颗粒,帮助病毒侵染细胞,例如壳体蛋白、膜糖蛋白和存在于病毒颗粒中的酶等;另一种是非结构蛋白,则帮助病毒在宿主细胞里复制、基因表达,扩大在人体内的“领地”。

早在1月10日,中国公布新冠病毒全基因组序列。但仅仅知道基因组序列,并不能充分了解蛋白质是如何工作的。

“蛋白质的成分包括20种氨基酸,每个蛋白质由几十到上千个氨基酸组成。部分氨基酸的线性序列会形成螺旋或者折叠状的二级结构,并进一步有序组合堆积成三维结构,这种三维结构决定了蛋白质在人体内如何发挥作用。”中国药科大学药学院教授肖易倍接受采访时,打了个比方,如果说人体的病毒受体是锁,病毒的刺突糖蛋白就是钥匙,如果这些钥匙能插进人体病毒受体蛋白,就会侵染细胞,科学家要做的,就是弄清楚钥匙内的三维结构是什么、钥匙和锁的关系是什么,进而阻止钥匙去开锁,即阻止病毒侵染细胞。

“知道了蛋白质如何发挥功能,就知道如何有针对性地抑制病毒活性,如果发现某个蛋白是入侵宿主细胞的关键蛋白,就可以针对这个蛋白或者蛋白的某个区域做药物设计。……

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