小拟南芥MKK基因家族全基因组鉴定及进化和表达分析

李晓翠，康凯程，黄先忠，范永斌，宋苗苗，黄韵杰，丁佳佳

研究报告

小拟南芥MKK基因家族全基因组鉴定及进化和表达分析

李晓翠1，康凯程1，黄先忠2,3，范永斌1，宋苗苗1，黄韵杰1，丁佳佳1

1. 石河子大学生命科学学院，植物基因组学实验室，石河子 832003 2. 安徽科技学院农学院，凤阳 233100 3. 石河子大学生命科学学院，石河子 832003

丝裂原活化蛋白激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinase, MAPKK或MKK)是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)级联的重要组成部分，在植物的生长发育和胁迫应答过程中发挥重要作用。目前，已在多种植物中鉴定了MKK基因家族，但在十字花科植物小拟南芥()中MKK基因家族的系统鉴定与分析尚未见报道。为了探索小拟南芥MKK基因家族的进化和功能，本研究通过全基因组分析鉴定了小拟南芥中16个基因，散布于小拟南芥的10条染色体上。基于系统发育分析和多重序列比对，将这些基因分为5个亚族：A亚族(5个)、B亚族(2个)、C亚族(4个)、D亚族(3个)和E亚族(2个)。分子进化和共线性分析表明小拟南芥中存在7对复制基因，分别是/、/、/、/、/、/和/，其中/在复制事件之后发生了加速进化。结合启动子区的顺式元件分布和在成熟叶片、茎、花和果实以及盐胁迫下的表达模式，结果发现复制基因的表达具有组织特异性和功能多样性。部分复制基因在组织中的表达模式存在差异，但在盐胁迫下的表达模式却基本相同。本研究结果为解析MKK介导的小拟南芥发育过程和非生物胁迫信号转导通路的复杂机制奠定了基础。

MKK；小拟南芥；基因家族；组织表达；……