基于ITS和RLKs序列的苦荞种质资源遗传多样性分析

2020-06-01 07:47:32张久盘常克勤杨崇庆穆兰海杜燕萍
南方农业·下旬 2020年1期
关键词:苦荞

张久盘 常克勤 杨崇庆 穆兰海 杜燕萍

摘 要 为明确苦荞资源的遗传多样性水平及遗传关系,对45份苦荞地方品种的ITS和RLKs序列进行基因测序和序列比较分析。结果显示,苦荞ITS和RLKs扩增序列较为保守,基因多态位点数分别占10.6%和7.7%。云贵川地区苦荞材料的遗传多样性最丰富,陕西、山西及宁夏地区次之,甘肃及内蒙古地区最低。四川和贵州地区的苦荞品种均能够单独聚为一类,基于ITS序列构建的NJ树中,陕西地区以北的苦荞品种未形成明显的分支,而云南地区的苦荞穿插在不同的分支中;基于RLKs基因构建的NJ树中,同一地区的苦荞材料较为明显地形成地域聚类,但自展值均较低。

关键词:苦荞;遗传多样性;ITS;RLKs

荞麦(Fagopyrum tataricum)又称乌麦、三角麦、花荞、荞子,属于蓼科(Polygnaceae)荞麦属(Fagopyrum),起源于我国西南地区[1]。目前,发现荞麦共有28个种、亚种和变种,而荞麦栽培种仅有甜荞和苦荞,其生物学特征及栽培适宜区域均有所不同[2]。荞麦营养成分均衡,富含赖氨酸[3-5]及黄酮类化合物,具有降低“三高”、软化血管、保护视力和预防脑溢血的作用[6-7],是药食兼用的保健和功能产品。由于荞麦具有抗逆性强、适应性广、耐瘠薄耐粗放等优点,成为生产条件较差的地区大量种植的粮食作物。

过去国内外学者多采用形态学标记、细胞学标记、种子蛋白标记和同工酶标记等方法对荞麦亲缘关系及遗传多样性进行分析,但分子标记技术已成为近年来最主要的种质资源遗传多样性分析手段,国内外广泛使用RAPD、AFLP、SSR等分子标记来评价荞麦遗传多样性。……

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