宁乡猪GADD45G基因多态性研究

2020-06-07 08:58曾勇波马海明
国外畜牧学(猪与禽) 2020年5期
关键词:宁乡蒸馏水外显子

曾勇波,马海明

(1 宁乡市动物疫病预防控制中心,湖南 宁乡 410600;2 湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)

哺乳动物的生长阻滞和DNA损伤诱导蛋白45(Growth Arrest and DNA Damage Inducible Gamma 45,GADD45G)是一类重要的信号换能器,并参与调节细胞的多种功能。GADD45G基因在人类基因去甲基化方面研究较多,但该基因在猪上的研究极少。鉴于国内外对猪GADD45G基因的研究甚少,我们开展了宁乡猪GADD45G基因分子遗传特性研究,以便为揭示GADD45G基因对猪肉质性状的研究奠定基础。

1 材料与方法

1.1 样品采集

选择325头大白猪和67头宁乡猪,采集猪耳小块组织样本,随后提取DNA。

1.2 PCR扩增条件

正向引物为5'-AAA CTT GCT GCT TGC G-3';反向引物为5'-GGA TGG AGG CGA CAC T-3'。

1.2.1 PCR反应体系(总体积20 μL)

10×Buffer 2 μL,2 mmol/L dNTPs 1.6 μL,20 mmol/L MgCl21.6 μL,TaqDNA聚合酶 (5 U/μL)0.4 μL,DNA模板(100 ng/μL)1 μL,上下游引物(10 pmol/μL)各0.4 μL,双蒸蒸馏水(dd H2O) 12.6 μL。

1.2.2 PCR反应程序

94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸50 s,共35个循环;72 ℃后延伸8 min,最后4 ℃保存。

1.3 PCR产物Pst I酶切

在10 μL PCR产物中加入0.8 μL 10×内切酶缓冲液、0.2 μL限制性内切酶和1 μL双蒸蒸馏水,总体积为12 μL,37 ℃消化4 h~10 h。

A/G位点用2%琼脂糖凝胶电泳分析,5 V/cm电压电泳0.5 h(图1),扩增片断为第1外显子至第2外显子,共804 bp,为PCR-RFLP-PstI分子标记。

2 结果与分析

在扩增的804 bp的片断中,GADD45G基因的PstI的酶切位点A/G位点存在3种基因型:AA型(804 bp)、AG型(164 bp+640 bp+804 bp)和GG型(164 bp+640 bp)。对GADD45G基因A/G位点的基因频率和基因型频率进行检测,PCR-RFLPPstI多态性的分布情况如表1所示,宁乡猪GADD45G基因A/G位点均存在AA基因型、GG基因型以及AG基因型,AG基因型频率较高,基因频率分别为0.08、0.73和0.19;A基因和G基因的频率分别为0.45和0.55,A/G位点的基因型大部分处于杂合状态。

3 讨论与结论

经卡方检验,宁乡猪GADD45G基因A/G位点处于哈代-温伯格平衡状态,表明本研究结果可靠。本研究为宁乡猪的保种和系统选育奠定了理论基础。

猜你喜欢
宁乡蒸馏水外显子
宁乡经开区“万名工人学党史”
宁乡经济技术开发区:不断强化四种能力 奋力争创五好园区
外显子跳跃模式中组蛋白修饰的组合模式分析
热压式蒸馏水机和多效蒸馏水机制备注射用水的质量比较
吹响“冲锋号” 按下“快进键”——宁乡经开区深入开展“大干一百天,实现双过半”大竞赛活动
外显子组测序助力产前诊断胎儿骨骼发育不良
外显子组测序助力产前诊断胎儿骨骼发育不良
浅谈蒸馏法制备注射用水的设备和方法
宁乡:人才是医院“核心利益”
人类组成型和可变外显子的密码子偏性及聚类分析