利用基因组预测方法对玉米根尖分生组织相关性状进行预测（2020.5.29 Plant Biotechnology Journal）

丰富的遗传资源是应对作物品质改良和粮食安全挑战的重要保障，如何利将这些保存的遗传资源进行有效利用是目前育种工作中需要解决的重要问题。近些年来，基因组预测作为一种“高性价比”的策略被逐渐运用于评估和利用潜在的、有价值但探索不足的种质资源，以此充分发挥遗传资源的潜力。

根尖分生组织（SAM）是一个由多能干细胞组成的群体，它能在植物中产生所有的地上器官。尽管SAM很小，但其形态与成株植物的密切表型相关，如开花时间、叶数、茎宽和其他农艺性状等。因此，对作物SAM形态变异的特征进行预测，可能有助于弥合未开发的遗传资源与优良品种之间的鸿沟。

2020年5月27日，国际著名植物学期刊Plant Biotechnology Journal在线发表了爱荷华州立大学Jianming Yu课题组题为”Genomic Prediction of Maize Micro‐Phenotypes Provides Insights for Optimizing Selection and Mining Diversity”的研究文章。文章报道了利用基因组预测方法对玉米根尖分生组织相关性状进行预测的研究内容。

文章中，作者利用435713个全基因组单核苷酸多态性（SNPs），基于369个自交系的模型，预测了2687个不同玉米自交系的根尖分生组织形态特征。

通过对488个自交系的实证检验结果表明，对8个与根尖分生组织相关的性状的预测精度为0.37～0.57。

虽然计算机模拟已经证明了可靠性对预测精度的影响，但在之前的研究者这并没有通过大规模的设计实验得到明确的证明。在本研究中，作者设计了一个高U值（可靠性上限）的验证集和一个来自不同玉米群体的低U值的验证集，以评估根尖分生组织性状的預测精度。……