贵州黑山羊BMP15基因多态性及生物信息学分析

李平 李潇蒙 龙清孟

关键词：贵州黑山羊;BMP15;SNPs;生物信息学

骨形态发生蛋白15（BMP15）又称生长分化因子9B，不仅能够促进颗粒细胞分裂、分化，而且能够抑制颗粒细胞中FSHR基因的表达[1]，同时能够促进卵泡发育[6-7]。BMP15基因由1个内含子与2个外显子构成，2个外显子被内含子隔开，外显子全长1 176 bp，共编码393个氨基酸残基的前蛋白。通过大量研究发现，BMP15基因可能与高繁殖性状有关，研究人员已在国内优良地方品种的绵羊上对BMP15基因展开相关研究，以期为构建高繁殖力群体奠定基础。目前，已在少数绵羊品种上发现BMP15基因与繁殖性状有关联，在小尾寒羊上发现BMP15基因B2处突变对高繁殖性状影响作用十分明显[4-5]。程俐芬等人研究发现BMP15基因在第一外显子中虽存在突变位点，但对绵羊繁殖性状并没有显著影响[3]。吴翠玲等研究6个绵羊群体发现，BMP15基因外显子1上在58～60 bp处有3个碱基（CTT）缺失[1]。本研究通过PCR产物直接测序技术并结合生物软件对贵州黑山羊BMP15基因进行多态性研究与生物信息学分析，预测mRNA二级结构、蛋白质二级结构、三级结构，以期为今后研究贵州黑山羊繁殖性状提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 血液DNA提取

102只贵州黑山羊血液样本，来自册亨县冗渡镇贵州领头羊山地草牧业科技有限公司。血液DNA提取采用天根血液基因组DNA提取试剂盒，提取后用1%琼脂糖凝胶电泳对DNA进行检测，检测结果发现条带清晰明亮、无RNA和蛋白质等污染。通过微量紫外分光光度计检测DNA质量D260 nm/D280 nm均在1.8～2.0之间，说明DNA提取效果好，纯度高。……