内蒙古锡林郭勒草原主要野生蘑菇分子进化及其系统发生学

李亚娇 孙国琴 郭九峰

关键词：草原蘑菇;ITS序列;分子系统发生学;系统进化树;分化时间

系统发生（phylogeny）也称系统发育、系统演化，是某一个类群的形成和发展过程，也就是进化或演化关系[1-2]。草原蘑菇主要生长在我国内蒙古中部草原地区，在草原上形成蘑菇圈，维持牧草与草原蘑菇共生的生态体系[3]。目前对草原蘑菇分类的研究一直处于形态学分类研究阶段，运用分子标记对其属内种类进行系统发生分析的研究还是比较滞后的。国内外有大量关于运用系统发生学研究食用菌分类的报道[4-6]。武冬梅运用分子系统发生学探究新疆野生羊肚菌在物种水平上表现出较高的遗传多样性[7]。刘晓亮等通过分子系统发育学对东北大小兴安岭地区的红菇属进行物种多样性分析，共鉴定出23个红菇属物种，其中有3个种此前从未在我国报道过，分别是果香红菇、暗红红菇和诺尔亚红菇[8]。目前，利用草原蘑菇内转录间隔区（ITS）序列进行系统发生学探究还未见报道，本研究通过18S和ITS 2组通用引物扩增草原蘑菇基因组DNA片段，产物直接测序，结合BLAST、MEGA 6.0等生物信息学软件进行序列比对、遗传参数计算，以及构建系统进化树、分子钟等[9-11]，以期为草原蘑菇的鉴定、进化分类及遗传育种方面的深入研究提供数据参考。

核糖体DNA（rDNA）中既包含保守的编码区18S、5.8S和28S，适合种以下水平的研究[12-13]，又包含进化速率较快的非编码区，内转录间隔区1内转录间隔区和2（ITS1和ITS2）以及非转录区，承受的进化选择压力较小，进化速度较快，适合属以下水平的研究[14-15]。……