多发性骨髓瘤患者与健康人脂肪基质细胞差异的关键基因测定及分析

宋宜来，刘中国

山西医科大学第一医院，山西太原 030001

多发性骨髓瘤(multiple myeloma，MM)是一种血液恶性肿瘤，其特征为骨髓中B淋巴细胞的克隆增殖，因此多发性骨髓瘤是一种B淋巴细胞淋巴瘤的血液系统疾病。近年来间充质干细胞(MSC)作为血液系统肿瘤治疗的新型方法得到了广泛的关注[1-4]。但是随着对MSC研究的不断深入，有人发现与源自正常供体(ND-hMSC)的MSC相比，MM患者来源的MSC(MM-hMSC)在遗传和功能上是不同的，自体MM骨髓间质细胞的移植不能解决间充质干细胞的来源问题[5]。为进一步探索间充质干细胞的来源问题，明确是否自体来源的脂肪间充质干细胞是一种理想的细胞来源，我们对健康人与MM患者的脂肪基质细胞进行了比较，为脂肪基质细胞的来源提供参考依据。

材料与方法

1 材料 GSE133346微阵列芯片数据包以及其平台文件GPL570-55999来自基因表达数据库(NCBI-GeneExpression Omnibus GEO)数据库，以“多发性骨髓瘤和脂肪基质细胞”为关键词搜索而来，包含样本24个，共分2组，分别为健康人和MM患者的脂肪基质细胞，每组12个人类样本。R语言软件以及操作指令代码来自在线平台 (Bioconductor http：//www.bioconductor.org)。 蛋白质互作网络图(PPI)利用蛋白功能关系网络数据库STRING(http：//string-db.org)构建后下载，并通过软件Cytoscape二次构建。注释、可视化和集成数据库在线数据平台(DAVID https：//david.ncifcrf.gov)对差异基因进行基因聚类分析(GO聚类分析和KEGG通路分析)。肿瘤关键基因的生存预后分析由癌症数据在线分析、挖掘网站(UALCAN http：//www.ualcan.path.edu/index.html)在线分析而得。

2 健康和MM患者脂肪基质细胞差异基因的筛选下载GSE133346微阵列芯片数据包，通过R语言软件对芯片进行质量监控，在确认芯片质量的情况下对芯片数据RMA法矫正。……