铜绿假单胞菌遗传演化分析

崔垚鑫，刘俊华，周忆莲，刘燕霏，杨建德

铜绿假单胞菌遗传演化分析

崔垚鑫，刘俊华，周忆莲，刘燕霏，杨建德通信作者

（天津农学院 动物科学与动物医学学院，天津 300384）

为研究铜绿假单胞菌（Pa）的遗传演化规律，对2018年本实验室分离出两株铜绿假单胞菌，经基因测序得到16s rRNA基因序列，利用NCBI中的BLAST对比搜索与分离菌株具有相近基因序列的假单胞菌株，采用lasergene 中Megalign软件构建基因进化树并比较分析。结果表明：Pa菌株在基因进化树上聚为一支，说明Pa进化较稳定，分离出的两株Pa与来自日本的Pa（登录号为NR_113599）关系最为亲近，他们聚在一个次级分支上；分离菌株与来自美国的两株Pa（登录号为NR_117678与NR_114471）关系较亲近，而与来自德国的Pa（登录号为NR_026078）关系则较远。

铜绿假单胞菌；遗传演化；基因树；亲缘关系

铜绿假单胞菌，又称绿脓杆菌，为革兰阴性杆菌，该菌在1882年首先由Gersard氏从伤口脓液中分离到[1]。铜绿假单胞菌在环境中普遍存在，常见于正常人与动物肠道、皮肤上，也可在外伤、烧伤及尿道感染等处发现。铜绿假单胞菌可感染多种动物，造成不同程度的经济损失，常见的疾病如雏鸡的急性败血死亡、貂的出血性肺炎、羊的化脓性肺炎、竹鼠的急性死亡等[2-6]。近些年来，因为铜绿假单胞菌感染人与动物的报道与日俱增，逐渐引起了人们的注意。

16S rRNA基因长度约为1 542 bp，序列长度适中，其结构中既有保守区又有变化区域，是较良好的生物标识[7-8]。基因测序技术快速发展，特别是高通量测序（high-throughput sequencing，HTS）的出现，在微生物鉴别方面起到了一定的作用[9-10]。……