张翠桔 莫蓓莘 陈雪梅 崔洁
(深圳大学生命与海洋科学学院,深圳 518037)
MicroRNA(miRNA)是一类真核生物中广泛存在的约20-24个核苷酸(Nucleotide,nt)长度的内源非编码单链RNA,成熟的miRNA与Argonaute(AGO)家族蛋白结合形成RNA诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC), 在转录后水平负调控基因表达。miRNA在生物的细胞增殖分化、生长发育和响应外界环境信号等多种生物过程中发挥重要作用。1993年和2000年,Ambros与Reinhart的研究小组分别先后在秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中鉴定了最早的动 物 miRNA,lin-4和let-7[1-2]。2002 年 Bartel、Carrington与Chen分别带领各自的研究小组发现了植物拟南芥中的miRNA[3-5]。几十年来,科学家已经在动植物中发现了数以万计的miRNA,2018年10月miRBase收录了38 589条miRNA前体信息,这些前体共计产生48 860条不同的成熟miRNA;其中人类基因组中鉴定发现2 654个成熟miRNA,拟南芥中发现428个成熟miRNA[6]。有关miRNA产生的生物学过程、功能分析、逆境胁迫等方面的研究报道逐年攀升,miRNA已然成为科学研究领域炙手可热的“明星分子”。
2002年,研究者们发现植物中第一个miRNA,“miR171”,同时发现植物miRNA与靶基因序列高度互补配对的特性[3-5]。在此之前的1999年,植物中首次发现了小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)。siRNA与靶基因完全互补配对,通过剪切靶基因mRNA调控基因的表达[7]。基于siRNA作用机制的启示,Llave[4]发现miR171也是通过剪切mRNA沉默靶基因。有趣的是,miR171既是植物miRNA作用方式的第一个实例,也是植物中少数与靶基因完全互补配对的miRNA之一。在miRNA被陆续发现和报道的前期,通过定量PCR检测mRNA水平的实验技术非常成熟,对靶基因mRNA水平的检测成为早期主流手段,因此植物miRNA对靶基因mRNA剪切的现象被大量报道。然而,蛋白水平的检测需要借助特异性强且灵敏度高的抗体,植物蛋白抗体开发的不足大大限制了对miRNA靶基因蛋白水平的检测。……