冯逸龙 张文利
(南京农业大学农学院 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室 江苏省现代作物生产协同创新中心,南京 210095)
鸟嘌呤(G)四联体,又称作G-quadruplex或G4等,广泛存在于生物体基因组中。它是由富含G串联重复序列的DNA或RNA折叠形成的一种高级结构。相同或不同平面的G主要是以CGC三联体形式,通过Hoogsteen氢键相互连接形成了一种更加稳定的二级结构[1]。DNA-G4假设模型最早于1958年被提出,但直到1962年才由Gellert 等[2]通过X-Ray手段证实了该模型的真实性。由于受到当时研究手段的制约,人们对G4结构及其生物学功能认识非常有限。直到20世纪90年代,一系列用于体内外检测G4位点的物理、生化以及免疫学等相关检测技术的发展和应用,G4结构及其生物学功能重新引起了人们的广泛关注。目前,人和动物G4研究已成为人类疾病治疗和药物基因组学研究的热点之一。
目前已有的研究结果表明,生物体G4具有一系列重要的生物学功能,如稳定染色质状态[3-4]、参与细胞周期[5]、调节离子跨膜运输[6]、参与表观遗传调控[7-11]、调控基因表达[9,12-13]以及参与DNA损伤和修复[14]等。尤为重要的是,G4现已作为潜在的靶标位点用于人类疾病治疗[15-19]。例如,I期临床试验结果显示,小分子合物CX-5461用于治疗因BRCA1/2缺陷而引起的肿瘤是与它可以稳定体内G4有关[20]。与人及动物G4研究相比,植物G4的鉴定及其生物学功能研究远远滞后。目前,除G4-seq被首次用于在全基因组水平鉴定拟南芥G4位点外,多数植物G4的位点还主要依赖于生物信息学方法,根据形成G4的核心序列在全基因组水平进行预测[21],这种预测的准确性还有待于进一步验证。……