ALK5抑制剂的设计、合成及其生物学活性评价

2020-09-14 02:09王小伟刘晓蓉王亚洲李志裕
中国药科大学学报 2020年4期
关键词:氧基丙基吡唑

许 涛,王小伟,刘晓蓉,王亚洲*,李志裕

(1中国药科大学药学院,南京210009;2南京圣和药业股份有限公司,南京211100)

转化生长因子家族配体包括TGF-βs、抑制素、激活素、骨形成蛋白、生长和分化因子,在细胞增殖、分化、凋亡、迁移、细胞外基质表达和免疫应答等众多过程中都发挥着重要作用[1-2]。TGF-β 活化后,在细胞表面与TGF-β RII 结合并使其激活,活化的TGF-β RII 募集并结合TGF-β RI(ALK5)形成异源三聚体复合物,通过激活Smad2/3 将信号传导至胞浆,Smad2/3 再与Smad4 结合形成复合物,然后转入细胞核以调节各种靶基因的转录[3]。除了经典的Smad 途径外,TGF-β 还可激活非Smad途径,如促分裂原激活蛋白激酶(MAPK)通路等[4]。

以往研究报道,在乳腺癌、结直肠癌、肝细胞癌等多种肿瘤类型中,TGF-β 及其信号通路高表达[5]。TGF-β 信号转导在介导肿瘤微环境的原发性改变和促进肿瘤细胞转移、侵袭和免疫逃逸过程中发挥重要作用[6-7]。作为TGF-β 信号通路中的重要节点蛋白,ALK5 是治疗TGF-β 信号转导异常相关疾病的理想靶标,也是目前针对TGF-β 信号通路开发小分子抑制剂的主要靶标。

目前共有6个ALK5小分子抑制剂进入临床研究阶段,其中公开结构的有3 个(图1)。LY-3200882 是礼来公司开发的新一代ALK5 抑制剂,通过ATP 竞争结合位点抑制ALK5 激酶活性,阻断TGF-β 与其受体结合。LY-3200882 是一种强效的ALK5 激酶抑制剂(IC50= 90 nmol/L),在多个实验动物肿瘤模型中也表现出显著的抗肿瘤活性,目前正处于实体瘤治疗的Ⅱ期临床试验[8]。

Figure 1 ALK5 inhibitors in clinical phase

为了寻找新型ALK5 激酶抑制剂,本研究选取LY-3200882 作为先导化合物,通过分析LY-3200882与ALK5蛋白的作用方式(图2),发现母核C 区的吡啶氮原子作为氢键受体与激酶铰链区His283 骨架的NH 之间形成一个关键的氢键作用,在吡唑环所处的选择性口袋中,存在一个水分子介导的氢键作用。以往研究报道,这两个氢键相互作用分别对化合物的ALK5 激酶抑制活性和p38 MAPK选择性至关重要[9]。

Figure 2 Proposed binding mode of LY-3200882(pdb code:2wou)

根据以上分析,对活性起关键作用的母核C区予以保留,利用生物电子等排、构象限制等策略,结合分子对接技术,设计了两类结构新颖的化合物(图3)。首先,通过改造处在溶剂区的侧链得到A 系列化合物,探索理化性质对抑制活性的影响,初步确定A 区优势基团,进而改造另一端侧链得到B系列化合物,以期筛选出活性和成药性更优的化合物。

Figure 3 Molecular design based on the structure of LY-3200882

1 合成路线

目标化合物的合成如路线1 所示。化合物1与2-氯吡啶-4-醇在DMF中用碳酸钾为碱反应得到化合物2,再与DMF-DMA 反应形成化合物3,经水合肼关环生成化合物4,随后与烷基化试剂环丙基硼酸在Chan-Lam 偶联条件下反应得到化合物5,最后和相应的胺经Buchwald-Hartwig 偶联得到目标化合物。

Scheme 1 Synthetic route of the target compounds

2 实验部分

2.1 仪器与试剂

Bruker Avance ⅢHD 400 MHz 型核磁共振仪(德国Bruker 公司,TMS 为内标);Q Exactive 高分辨质谱仪(美国Thermo 公司);MP70 型熔点仪(瑞士Mettler-Toledo 公司);Waters e2695 型高效液相色谱仪(美国Waters 公司);所用化学试剂均为市售化学纯或分析纯产品,一般均不经纯化处理直接使用。

ALK5 激酶(Carna 公司,批号09-141);Bright-Glo Luciferase assay system(美国Promega 公司);Luc-Smad2/3-NIH3T3 小鼠成纤维细胞,由中国药科大学徐晓军研究员实验室馈赠。

雄性BALB/c 小鼠,体重(18~22 g),购自常州卡文斯实验动物有限公司,许可证号:SCXK(苏)2016-0010。

2.2 化学合成

2-((2-氯吡啶-4-基)氧基)-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)乙-1-酮(2)

氩气保护下,将化合物1(1.45 g,7.0 mmol)的无水DMF(5 mL)溶液加入到2-氯-4 羟基吡啶(0.91 g,7.0 mmol),碳酸钾(1.48 g,14.0 mmol)和无水DMF(20 mL)的混合物中,升温至90 ℃反应2 h。降至室温,加入饱和食盐水,乙酸乙酯萃取,无水Na2SO4干燥,减压除去溶剂得红色油状物1.47 g,收率82%,ESI-MS(m/z):257.1[M+H]+。

(E)-2-((2-氯吡啶-4-基)氧基)-3-(二甲基氨基)-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)丙-2-烯-1-酮(3)

将化合物2(1.47 g,5.74 mmol),1,1-二甲氧基三甲胺(3.24 mL,24.4 mmol)加热至100 ℃回流反应2 h。冷却,加入乙酸乙酯,饱和食盐水洗涤,无水Na2SO4干燥,旋干溶剂得棕色油状物1.78 g,收率99%,ESI-MS(m/z):312.0[M+H]+。

2-氯-4-((3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶(4)

将化合物3(1.78 g,5.74 mmol)溶于醋酸溶液60 mL 中,冰浴下用恒压滴液漏斗加入水合肼(3.0 g,60.0 mmol),室温反应过夜。加入乙酸乙酯,饱和碳酸氢钠溶液洗涤,无水Na2SO4干燥,减压除去溶剂得棕色粗品1.05 g,无需纯化,直接用于下一步,ESI-MS(m/z):281.1[M+H]+。

2-氯-4-((1-环丙基-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶(5)

将2,2′-联吡啶(0.70 g,4.4 mmol),乙酸铜(0.80 g,4.4 mmol)和1,2-二氯乙烷(10 mL)于75 ℃反应25 min,冷却至室温。加入化合物4(1.12 g,4.0 mmol),环丙基 硼 酸(0.69 g,8.0 mmol)和碳酸钠(0.85 g,8.0 mmol),氧气氛围下,75 ℃反应2 h。冷却至室温,加入饱和食盐水,二氯甲烷萃取,无水Na2SO4干燥,减压除去溶剂,柱色谱纯化得黄色固体1.10 g,收率86%;mp:112~114 ℃。ESI-MS(m/z):320.1[M+H]+。

4-((1-环丙基-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑-4-基)氧基)-N-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)吡啶-2-胺(A1)

氩气保护下,将化合物5(192 mg,0.60 mmol),2-三氟甲基-4-氨基吡啶(119 mg,0.78 mmol),4,5-双二苯基膦-9,9-二甲基氧杂蒽(69 mg,0.12 mmol),醋酸 钯(13.5 mg,0.06 mmol),碳 酸 铯(293 mg,0.90 mmol)溶于1,4-二氧六环15 mL,加热至100 ℃反应过夜。冷却,加入饱和食盐水,二氯甲烷萃取,无水Na2SO4干燥,旋干溶剂,制备HPLC 纯化得白色固体85 mg,收率31%;mp:168~170 ℃;纯度96.7%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.96(1H,s,pyrazole-H),8.45(1H,d,J=5.4 Hz,pyridine-H),8.25(1H,s,NH),8.22(1H,d,J=5.7 Hz,pyridine-H),7.90(1H,s,pyridine-H),7.80(1H,d,J=4.4 Hz,pyridine-H),6.70(1H,d,J=4.7 Hz,pyridine-H),6.40(1H,s,pyridine-H),3.83(2H,d,J=11.1 Hz,OCH2),3.69(1H,s,CH),3.30(2H,d,J=13.3 Hz,OCH2),2.72(1H,m,CH),1.67(4H,s,2-CH2),1.06(2H,s,CH2),0.96(2H,d,J=6.0 Hz,CH2);HR-MS(ESI)for C22H22F3N5O2[M+H]+:Calcd. 446.179 8;Found 446.179 2。

4-(4-((4-((1-环丙基-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)氨基)吡啶-2-基)-2-甲基丁-3-炔-2-醇(A2)

制备方法同化合物A1,将2-三氟甲基-4-氨基吡啶换成4-(4-氨基吡啶-2-基)-2-甲基丁-3-炔-2-醇,得白色固体25 mg,收率18%;mp:110~112 ℃;纯度92.8%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.60(1H,s,pyrazole-H),8.23(1H,d,J=5.5 Hz,pyridine-H),8.18(1H,d,J=5.7 Hz,pyridine-H),7.89(1H,s,pyridine-H),7.89(1H,s,NH),7.46(1H,d,J=4.5 Hz,pyridine-H),6.64(1H,d,J=4.6 Hz,pyridine-H),6.36(1H,s,pyridine-H),5.57(1H,s,OH),3.83(2H,d,J=11.1 Hz,OCH2),3.67(1H,m,CH),3.29(2H,s,OCH2),2.86~2.66(1H,m,CH),1.66(4H,s,2-CH2),1.48(6H,s,2-CH3),1.05(2H,s,CH2),0.99~0.91(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C26H29N5O3[M+H]+:Calcd. 460.234 3;Found 460.233 6。

N-(2-(1H-吡唑-4-基)吡啶-4-基)-4-((1-环丙基-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑-4-基基)氧基)吡啶-2-胺(A3)

制备方法同化合物A1,将2-三氟甲基-4-氨基吡啶换成2-(1H-吡唑-4-基)吡啶-4-胺,得淡黄色固体65 mg,收 率33%;mp:111~113 ℃;纯 度97.7%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:13.02(1H,s,NH),9.49(1H,s,pyrazole-H),8.24(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.18(1H,d,J=5.7 Hz,pyridine-H),8.04(2H,s,pyrazole-H),7.88(1H,s,NH),7.85(1H,s,pyridine-H),7.51(1H,d,J=5.3 Hz,pyridine-H),6.61(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),6.39(1H,s,pyridine-H),3.83(2H,d,J=11.3 Hz,OCH2),3.75~3.61(1H,m,CH),3.33(2H,d,J=4.2 Hz,OCH2),2.88~2.64(1H,m,CH),1.67(4H,s,2-CH2),1.03(2H,s,CH2),0.96(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C24H25N7O2[M+H]+:Calcd.444.214 2;Found 444.213 3。

2-(2-(4-((4-((1-环丙基-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)氨基)吡啶-2-基)苯基)丙-2-醇(A4)

制备方法同化合物A1,将2-三氟甲基-4-氨基吡啶换成2-(2-(4-氨基吡啶-2-基)苯基)丙-2-醇,得白色固体117 mg,收率67%;mp:195~197 ℃;纯度94.8%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.61(1H,s,pyrazole-H),8.38(1H,d,J=5.5 Hz,pyridine-H),8.20(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.14(1H,s,Ar-H),7.92(1H,s,NH),7.90(2H,s,Ar-H),7.66(1H,d,J=5.3 Hz,Ar-H),7.58(2H,d,J=7.8 Hz,pyridine-H),6.63(1H,d,J=5.7 Hz,pyridine-H),6.41(1H,s,pyridine-H),5.09(1H,s,OH),3.84(2H,d,J=11.2 Hz,OCH2),3.68(1H,m,CH),3.33(2H,m,OCH2),2.75(1H,m,CH),1.69(4H,s,2-CH2),1.47(6H,s,2-CH3),1.06(2H,s,CH2),0.96(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C30H33N5O3[M+H]+:Calcd.512.265 6;Found 512.264 6。

4-(4-((4-((1-环丙基-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)氨基)吡啶-2-基)四氢-2H-吡喃-4-醇(A5)

制备方法同化合物A1,将2-三氟甲基-4-氨基吡啶换成4-(4-氨基吡啶-2-基)四氢-2H-吡喃-4-醇,得白色固体85 mg,收率28%;mp:92~94 ℃;纯度96.6%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.53(1H,s,pyrazole-H),8.24(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.14(1H,d,J=5.8 Hz,pyridine-H),7.88(1H,s,NH),7.78(1H,s,pyridine-H),7.71(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),6.59(1H,d,J=7.8 Hz,pyridine-H),6.38(1H,s,pyridine-H),5.18(1H,s,OH),3.83(2H,d,J=8.6 Hz,OCH2),3.79~3.70(4H,m,2-OCH2),3.70~3.63(1H,m,CH),3.31(2H,m,OCH2),2.79~2.63(1H,m,CH),2.17(2H,m,CH2),1.66(2H,m,CH2),1.40(2H,d,J=12.9 Hz,CH2),1.04(2H,m,CH2),1.00~0.86(2H,m,CH2);HR-MS(ESI) for C26H31N5O4[M+H]+:Calcd.478.244 9;Found 478.244 0。

4-(4-((4-((1-环丙基-3-(4,4-二氟环己基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)氨基)吡啶-2-基)四氢-2H-吡喃-4-醇(B1)

制备方法同化合物A5,将2-溴-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)乙-1-酮换成2-溴-1-(4,4-二氟环己基)乙烷-1-酮,得白色固体170 mg,收率26%;mp:56~58 ℃;纯度96.9%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.52(1H,s,pyrazole-H),8.24(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.14(1H,d,J=5.8 Hz,pyridine-H),7.88(1H,s,NH),7.77(1H,d,J=1.9 Hz,pyridine-H),7.70(1H,dd,J=5.6,2.1 Hz,pyridine-H),6.58(1H,dd,J=5.8,2.2 Hz,pyridine-H),6.38(1H,d,J=2.2 Hz,pyridine-H),5.17(1H,s,OH),3.73(4H,m,2-OCH2),3.67(1H,m,CH),2.68(1H,m,CH),2.16(2H,m,CH2),2.01(2H,m,CH2),1.86(4H,m,2-CH2),1.68(2H,m,CH2),1.40(2H,d,J=12.7 Hz,CH2),1.04(2H,m,CH2),0.97~0.92(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C27H31F2N5O3[M+H]+:Calcd. 512.246 8;Found 512.246 6。

4-(4-((4-((3-(3- 唑环[3.1.0]己-6-基)-1-环丙基-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)胺基)吡啶-2-基)四氢-2H-吡喃-4-醇(B2)

制备方法同化合物A5,将2-溴-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)乙-1-酮换成1-(3-氧杂环[3.1.0]己烷-6-基)-2-溴乙烷-1-酮,得白色固体135 mg,收率14%;mp:63~65 ℃;纯度98.2%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.52(1H,s,pyrazole-H),8.24(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.14(1H,d,J=5.8 Hz,pyridine-H),7.85(1H,s,NH),7.78(1H,d,J=1.8 Hz,pyridine-H),7.69(1H,dd,J=5.6,2.0 Hz,pyridine-H),6.59(1H,dd,J=5.8,2.2 Hz,pyridine-H),6.43(1H,d,J=2.1 Hz,pyridine-H),5.17(1H,s,OH),3.80~3.70(6H,m,3-OCH2),3.69~3.64(1H,m,CH),3.59(2H,m,OCH2),2.17(2H,m,CH2),1.87(2H,d,J=8.0 Hz,CH2),1.62(1H,t,J=7.8 Hz,CH),1.41(2H,d,J=12.8 Hz,CH2),1 . 04(2H,m,CH2),0.96-0.92(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C26H29N5O4[M+H]+:Calcd. 476.229 2;Found 476.228 1。

4-(4-((4-((1-环丙基-3-苯基-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)氨基)吡啶-2-基)四氢-2H-吡喃-4-醇(B3)

制备方法同化合物A5,将2-溴-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)乙-1-酮换成2-溴-1-苯乙烷-1-酮,得白色固 体65 mg,收 率21%;mp:137~139 ℃;纯 度

99.6%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.49(1H,s,pyrazole-H),8.23(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.16(1H,d,J=5.8 Hz,pyridine-H),8.12(1H,s,NH),7.76(1H,d,J=1.6 Hz,pyridine-H),7.70(2H,d,J=7.4 Hz,Ar-H),7.66(1H,dd,J=5.6,1.9 Hz,pyridine-H),7.36(2H,t,J=7.6 Hz,Ar-H),7.28(1H,d,J=7.4 Hz,Ar-H),6.67(1H,dd,J=5.8,2.1 Hz,pyridine-H),6.43(1H,d,J=2.0 Hz,pyridine-H),5.17(1H,s,OH),3.82(1H,m,CH),3.79~3.63(4H,m,2-OCH2),2.16(2H,m,CH2),1.39(2H,d,J=12.9 Hz,CH2),1.16(2H,m,CH2),1.04(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C27H27N5O3[M+H]+:Calcd. 470.2187;Found 470.2180。

4-(4-((4-((1-环丙基-3-(2-氟苯基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)氨基)吡啶-2-基)四氢-2H-吡喃-4-醇(B4)

制备方法同化合物A5,将2-溴-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)乙-1-酮换成2-溴-1-(2-氟苯基),得白色固体32 mg,收率22%;mp:67~69 ℃;纯度93.6%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.50(1H,s,pyrazole-H),8.23(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.16(1H,s,NH),8.09(1H,d,J=5.9 Hz,pyridine-H),7.76(1H,d,J=1.8 Hz,pyridine-H),7.67(1H,dd,J=5.6,1.9 Hz,pyridine-H),7.54(1H,m,Ar-H),7.44~7.35(1H,m,Ar-H),7.27~7.16(2H,m,Ar-H),6.57(1H,dd,J=5.8,2.2 Hz,pyridine-H),6.43(1H,d,J=2.1 Hz,pyridine-H),5.19(1H,s,OH),3.90~3.81(1H,m,CH),3.80~3.64(4H,m,2-OCH2),2.16(2H,m,CH2),1.38(2H,d,J=12.9 Hz,CH2),1.22~1.12(2H,m,CH2),1.04(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C27H26FN5O3[M+H]+:Calcd.488.209 2;Found 488.208 5。

4-(4-((4-((1-环丙基-3-(3-氟苯基)-1H-吡唑-4-基)氧基)吡啶-2-基)氨基)吡啶-2-基)四氢-2H-吡喃-4-醇(B5)

制备方法同化合物A5,将2-溴-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)乙-1-酮换成2-溴-1-(3-氟苯基),得白色固体28 mg,收率19%;mp:117~119 ℃;纯度99.8%;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:9.51(1H,s,pyrazole-H),8.24(1H,d,J=5.6 Hz,pyridine-H),8.17(1H,d,J=5.9 Hz,pyridine-H),8.15(1H,s,NH),7.77(1H,d,J=1.4 Hz,p yridine-H),7.67(1H,dd,J=5.5,1.8 Hz,pyridine-H),7.54(1H,d,J=7.8 Hz,Ar-H),7.48~7.35(2H,m,Ar-H),7.18~7.07(1H,m,Ar-H),6.69(1H,dd,J=5.8,2.1 Hz,pyridine-H),6.44(1H,d,J=1.9 Hz,pyridine-H),5.17(1H,s,OH),3.84(1H,m,CH),3.80~3.67(4H,m,2-OCH2),2.16(2H,m,CH2),1.40(2H,d,J=12.9 Hz,CH2),1.22~1.15(2H,m,CH2),1.09~0.98(2H,m,CH2);HR-MS(ESI)for C27H26FN5O3[M+H]+:Calcd. 488.209 2;Found 488.208 5。

2.3 ALK5激酶抑制活性评价

将化合物溶解于指示剂量的DMSO 中(从10µmol/L 按3倍稀释),用Echo转移化合物100 nL到384 孔反应板中。将ALK5 激酶加入1 倍激酶缓冲 液(40 mmol/L Tris,pH 7.5,0.10% BSA,20 mmol/L MgCl2,1 mmol/L DTT)中,形成2 倍酶溶液,向384 孔反应板中加入2.5 µL,室温孵育10 min。将FAM 标记的多肽和ATP 加入1 倍激酶缓冲液,形成2 倍底物溶液,并转移2.5 µL 至384 孔反应板,于28 ℃孵育120 min。转移反应液5µL到一块新的384孔板反应孔中,加入ADP-Glo试剂5µL终止反应,于28 ℃孵育120 min。转移激酶检测试剂10 µL 到反应孔中,振荡1 min,室温静置30 min。在Envision上读取发光值。

2.4 NIH3T3细胞活性评价

Luc-Smad2/3-NIH3T3 细胞 于10 cm 培养皿 中正常培养至汇合度达90%,消化后收集至15 mL 离心管中,1 000 r/min 离心5 min 后,去除上清液,用培养基1 mL重悬后,稀释10倍计数,根据计数后的结果稀释细胞,将每孔4 000个细胞数传入96孔板中(每孔加入重悬细胞100µL)。称取化合物2 mg,使用DMSO 配制成4 mmol/L 母液,用2% FBS 培养基稀释,加入1×化合物溶液100µL,使其终浓度分别为20 000,5 000,1 250,312.5,78.125,19.53,4.88,1.22 nmol/L,每孔TGF β1终浓度为4 ng/mL,与化合物一起用2% FBS 培养基稀释。然后移去细胞上清液,每孔加入Glo Lysis Buffer 100 µL,缓慢摇晃使其均匀溶解细胞,室温裂解5 min。每孔加入Bright-glo luciferase assay system 100µL,室温孵育5 min,振荡2 min,将上清液180µL 转入白底96孔板,检测化学发光信号。

2.5 药代动力学评价

单次口服给药(po)组:10 mg/kg,0.2 mL/10 g;单次尾静脉注射给药(iv)组:1 mg/kg,0.1 mL/10 g,n=3;po或给药后于5、15、30 min,1、2、6、10、24 h自眼眶静脉丛采血于肝素化EP 管(0.6 mL)中,暂置于碎冰上。然后以8 000 r/min 离心5 min,转移上层血浆15 µL,加甲醇-乙腈(1∶1)150 µL 沉淀(含1 ng/mL邻甲苯海拉明),振荡3 min,4 500 r/min,离心5 min,取上清液(容器:2 mL 深孔板)50µL,加入稀释剂(甲醇-水,1∶1)500µL,振荡3 min,4 500 r/min 离心5 min,转移上清液200 µL 用LC-MS/MS进样分析。根据上述步骤所得血药浓度数据绘制血药浓度-时间曲线图,用WinNonlin 软件求算药代动力学参数。

3 结果与讨论

目标化合物的体外活性结果如表1所示。在A系列化合物中,将A 区叔醇替换成吸电子基(A1-A2),激酶抑制活性明显降低。当引入不同环状给电子基(A3~A5)时,抑制活性与阳性药相当或更优,其中化合物A5 的抑制活性(IC50=2.4 nmol/L)最优,比阳性药提升2.5 倍。A 区构效关系表明,引入给电子基有助于增强活性,而吸电子基的引入则会导致活性明显损失。在细胞活性测试中,化合物A5 对NIH3T3 细胞中TGFβ-ALK5-SMAD2/3信号通路表现出较好的抑制活性(IC50= 69.6 nmol/L),于是确定四氢吡喃醇为A区优势基团。

通过固定四氢吡喃醇,利用生物电子等排,将B 区四氢吡喃环替换成二氟环己烷(B1),相比于阳性药,抑制活性显著提高(IC50=3.8 nmol/L),可能是因为二氟甲基的体积较氧原子略大,疏水作用的加强导致抑制活性提高。引入桥环结构(B2)活性与阳性药相当,表明四氢吡喃环上位阻对活性影响相对较小。当用苯环替换四氢吡喃环时(B3),抑制活性得到显著改善,可能苯环与结合口袋中某些氨基酸残基存在π-π堆积作用,使得结合力增强。此外,苯环上取代基及其位置对活性有一定影响,引入氟原子可进一步提高活性,且氟位于邻位时(B4)抑制活性更强(IC50= 1.4 nmol/L),具有阳性药31 倍的优势。在细胞活性测试中,化合物B4 对NIH3T3 细胞中TGFβ-ALK5-SMAD2/3 信号通路表现出最佳的抑制活性(IC50= 14.2 nmol/L)。基于化合物B4 良好的体外抑制活性,对其药代动力学性质做进一步考察。

Table 1 IC50 of the target compounds against ALK5 enzyme and NIH3T3 cell

药代动力学的评价结果如表2 所示。化合物B4 呈现较低的清除率(CL = 5.2 L·h-1·kg-1),暴露量(AUC=1 584.0 ng/mL·h)良好,半衰期为1.8 h,口服生物利用度达到85.0%,基本具备每天一次口服给药的潜力。

Table 2 Pharmacokinetic parameters of compound B4 a

为了进一步说明化合物的构效关系,本研究使用分子对接方法研究了化合物B4 与靶蛋白ALK5 在活性位点的结合模式(pdb:2wou)。通过图4 可以看出,化合物B4(紫色)保留了在ALK5 激酶铰链区与His283 的直接氢键作用,以及选择性口袋中水分子介导的氢键相互作用。另外发现化合物B4 与LY-3200882(绿色)母核部分叠合良好,与LY-3200882 不同的是,溶剂区吡喃环上的羟基与Asp290 形成一个氢键作用,B 区苯环上的对位氢原子与Lys337 形成一个非经典氢键。这些信息为后续ALK5 抑制剂的设计提供了借鉴和理论基础。

Figure 4 Proposed binding mode of B4(purple)and overlaid with LY-3200882(green)

4 小结

本研究通过分析LY-3200882 与ALK5 的结合模式,保留对活性起关键作用的母核区域,利用生物电子等排和构象限制等策略,设计并合成了10个目标化合物。通过两轮优化得到化合物B4,不仅表现出显著的体外抑制活性,而且具备良好的药代动力学性质,具有进一步开发的潜在价值。

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