DNA酶:筛选、生物传感及展望

2020-11-13 09:37:20佟宗轩胡沁沁顾宏周
高等学校化学学报 2020年11期
关键词:策略

佟宗轩,胡沁沁,顾宏周

(复旦大学附属中山医院心血管疾病研究所,复旦大学生物医学研究院,上海200032)

DNA酶又称为脱氧核酶(Deoxyribozymes,DNAzymes),通常由一定长度(几十个碱基)和特定序列的单链DNA通过折叠成某些二维和三维空间结构而获得催化功能.第一个DNA酶出现在1994年,Breaker等[1]利用指数富集的配体进化技术(SELEX),在试管内首次获得了可以在特定位点切割核糖核酸(RNA)的脱氧核糖核酸(DNA)序列[图1(A)],这项工作揭开了DNA酶的面纱.此后的系列研究发现,DNA酶可以像RNA酶(Ribozyme)和蛋白酶一样高效催化DNA/RNA连接、DNA磷酸化、DNA腺苷化、DNA脱嘌呤化及狄尔斯-阿尔德反应等生化反应[2~6].从化学的角度来看,DNA只比RNA少了1个2′-OH,其它化学官能团几乎完全相同,因此DNA像RNA一样具备多种催化功能.与RNA酶和蛋白酶相比,DNA酶具备一些天然的优势:因其构成为DNA,故稳定性极佳,且易于化学合成修饰、易于操作和储存且制备成本低. 这些优势推动了其在生物传感[7,8]、基因治疗[9~11]和生物成像[12,13]等领域的发展与应用.尽管已有数十种DNA酶在试管内进化分离出来,但迄今尚无很强的证据显示DNA酶在自然界中也存在.

除了一类可催化RNA连接反应[14]和一类可催化RNA切割反应[15]的DNA酶的工作机理在原子精度上得到了阐释之外,目前绝大多数DNA酶的工作机理尚未知,但DNA酶的催化方式有一定的共性.通常,DNA酶由非保守序列区和保守序列区两部分组成,前者的主要功能是通过碱基互补配对识别并作用于底物,在这个过程中后者与底物之间的距离拉近并可……

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