中国明对虾低温下显著上调表达抗凋亡与免疫相关类基因的筛选分析

闫潆心　李裕强　张梦茹　裴若怡　吴玉妹

摘要：为了筛选出中国明对虾（Fenneropenaeus chinensis）低温下显著上调表达的基因，揭示中国明对虾耐低温分子调控机制。利用DEseq2方法对3种类型中国明对虾常温和低温转录组进行差异表达基因（differential expression genes，DEG）检测，筛选出6条低温下显著上调表达的抗凋亡与免疫相关类基因。并运用生物信息学的分析方法，分析这些基因的表达产物，功能性状，以及低溫上调表达的原因。研究结果显示，6条中国明对虾低温上调表达基因的编码产物包括：发挥分子伴侣作用的HSP70、HSP20、DEAD-box RNA解旋酶，发挥抗凋亡作用的Pim-1激酶和富甘氨酸蛋白以及发挥免疫作用的丝氨酸蛋白酶。本研究筛选并鉴定了中国明对虾耐低温相关基因，揭示了其耐低温胁迫下分子调控机制，以期为中国明对虾耐低温品系育种工作的改良提供参考。

关键词：中国明对虾;耐低温性状;分子伴侣;抗凋亡;免疫力

中图分类号：S968.2        文献标识码：A

中国明对虾是我国重要的水产资源，温度是影响其生长发育的重要因素，4℃～38℃为中国明对虾的水温耐受范围，最佳生长温度为25℃，且放苗温度不可低于14℃[1]。对低温的不耐受导致中国明对虾冬季的养殖工作艰难，成活率下降，养殖成本大幅上升，最终影响了经济效益。因此，对中华明对虾耐低温相关基因进行研究，选育出耐低温且生长速度较快的优良新品种，对中国明对虾的资源保护十分重要。国内外对于水产动物耐低温相关基因的研究已有很多，如：孟宪红等[1]人利用高通量转录组测序筛选出中国明对虾的谷胱甘肽转移酶等5条低温上调表达基因，并利用RT-PCR技术验证其研究结果。……