胡师华,韦康来
肾母细胞瘤(Nephroblastoma,WT)是儿科最常见的恶性肿瘤之一,并且是最常见的肾癌类型(占所有小儿肾脏肿瘤的95%以上)。近年来,经过肿瘤研究和多模式治疗的显著进步,医学上对WT的诊治水平得到明显提升。然而,仍有相当一部分特别是患有复发性疾病的患者存活率相对较低,外科手术等治疗方式亦对小儿造成较大痛苦,许多WT 患者仍然面临与治疗相关的问题[1,2]。研究WT 相关基因和调控因子及其在肿瘤中的作用和产生影响的途径机制,依据能够识别或影响肿瘤生长的有效指标,进行推测和调控肿瘤生物学发生发展及复发情况,可以对WT 患儿进行前瞻性鉴定和更积极的治疗。而关于转录因子及其在各种病理生理过程中的作用的研究为癌症诊断和治疗增加了新途径[3]。
转录因子(TF)是一种能够在某些基因上游特异性结合的蛋白质,可以调节相应靶基因的表达,驱动一系列的细胞活动。有基础研究发现TF 在发育过程中起核心作用,决定细胞命运的转录因子的失活是致癌的重要步骤[4]。为此,我们拟从的TF 的角度研究调控机理并预测信号通路涉及的重要调控基因,探讨其在WT 中致病的机制,以支持WT 的诊断与治疗。染色质免疫共沉淀技术(ChIP)可以用于研究TF 结合位点或组蛋白特异性修饰位点,ChIP-Seq 技术是将ChIP 与第二代测序技术相结合,高效地在全基因组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互作的DNA 区段,通过将测序结果精确定位到基因组上可以获取全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。……