基于TCGA 和CGGA 数据库探究KIF15 在胶质瘤中的表达及临床意义

钟光华 郑守链 唐娉

胶质瘤是中枢神经系统最为常见的恶性脑肿瘤，患者预后极差。多形性胶质母细胞瘤（glioblastoma multiforme，GBM）是胶质瘤中最恶性的病理类型[1-3]。患者在接受最大安全的手术切除、大剂量放射治疗和标准化学治疗后，总体中位总生存率仍然较短[4]。导致GBM 患者治疗效果不理想的一个重要因素是，肿瘤内部细胞异质性以及胶质瘤肿瘤干细胞的存在，导致了肿瘤细胞内部存在耐受现有的免疫治疗和分子靶向治疗[5-7]。因此，发现新的生物标志物有助于肿瘤精准治疗的发展。驱动蛋白家族成员15（Kinesin Family Member 15，KIF15）是一种蛋白质编码基因，编码的蛋白与21q22.11q22.12 微缺失综合征和乳腺癌的发病有关[8-9]。目前，国内关于KIF15 在胶质瘤中的表达特征及临床意义的研究报道罕见。本研究通过挖掘美国癌症基因图谱计划（The Cancer Genome Atlas，TCGA）和中国脑胶质瘤基因图谱计划（Chinese Glioma Genome Atlas，CGGA）胶质瘤患者的肿瘤样本的全转录组数据，结合相关基因和蛋白表达数据库，初步探讨了KIF15 在胶质瘤中的表达特征及临床意义，现报道如下。

资料与方法

一、数据库

人类基因蛋白表达库数据（https://www.proteinatlas.org/）用于分析KIF15 在人体器官组织中的表达特征。TCGA 和CGGA 基因全转录组数据（mRNAseq） 用于分析KIF15 在各级别胶质瘤中的表达差异。

二、胶质瘤芯片及免疫组织化学染色

包含94 例胶质瘤样本（含WHO 标准下Ⅱ～Ⅳ级，其中Ⅱ级24 例，Ⅲ级31 例，Ⅳ级39）的肿瘤组织芯片（武汉谷歌生物科技有限公司）用于KIF15的免疫组织化学染色。染色方法：组织芯片经二甲苯脱蜡、乙醇脱水后，用柠檬酸钠缓冲液进行抗原修复，3%H2O2溶液去除内源性过氧化物酶活性。……