310例中国人基因组干扰素α1/α2基因多态性研究

王 兵，盛 海，卢 晨，程联胜，龚庆国

干扰素(interferons，IFNs)是一类具有抗病毒、抗增殖和免疫调节活性的细胞因子家族[1]，诱导同种细胞产生抗病毒蛋白，建立抗病毒应答，限制病毒的进一步复制和扩散，是机体天然免疫系统的关键组成部分[2,3]，临床上广泛用于治疗各种病毒感染性疾病。α-干扰素是临床上治疗慢性乙型肝炎(CHB)和慢性丙型肝炎(CHC)的一线用药，以往研究表明由于人体缺乏IFNα2a基因[4]，导致这类人群在应用IFNα2a后抗IFNα2a抗体产生率较高而影响药物的治疗疗效[5，6]。由于缺少大样本中国人群干扰素基因型分布的基础研究以及仅我国批准了IFNα1b上市，因此有学者认为IFNα1b来源于中国人脐带血白细胞，而IFNα2a和IFNα2b来源于西方白种人[7]，从而错误解读为IFNα1b属于中国人基因，IFNα2a和IFNα2b为外国人基因。为了彻底探明中国人群IFNα1和IFNα2基因的遗传背景，为临床用药提供参考，我们检索了千人基因组数据库上收录的中国人IFNα1和α2基因单核苷酸位点多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)，现将结果报道如下。

1 对象与方法

1.1 研究人群 选择千人基因组数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/)公布的2535例全人类双倍染色体基因组序列，其中有310例为中国人双倍染色体基因组序列。在这310例中国人中，男性147例，女性163例。包括北京汉族人(Han Chinese in Bejing, China)103例，南方汉族人(Southern Han Chinese)108例，西双版纳傣族人(Chinese Dai in Xishuangbanna,China)99例。

1.2 研究基因 干扰素α1基因(IFNA1)和干扰素α2基因(IFNA2)基因位于人类第9号染色体短臂[8]，基因IFNA1具体位置为Chr9: 21,440,453-21,441,315，全长863 bp，编码区为567 bp；基因IFNA2具体位置为Chr9: 21,384,254-21,385,396，全长1142 bp，编码区为564 bp。两个基因均包含5’-端非编码区(5’-UTR)、编码区(coding)和3’-端非编码区(3’-UTR)三个部分，其中编码区还包含信号肽区和成熟蛋白区。……