让AlphaFold的力量为全世界所用

2021-02-13 12:54:59德米斯哈萨比斯
世界科学 2021年9期
关键词:数据库人工智能生物

德米斯•哈萨比斯

2020年12月,我们向世界介绍AlphaFold 2及其在预测蛋白质结构方面的超凡能力。当时,评估者认为这是解决困扰科学界50年的重大问题——解析蛋白质三维结构——的最佳工具。2021年7月,我们在《自然》(Nature)刊载了两篇论文,发布了AlphaFold的开源代码,解释这个高度创新的体系是怎么来的;同时,我们还分享包括人体中存在的每一种蛋白质以及常用于科学研究的20种生物体的蛋白质的高质量预测。

科学家试图寻找各类疾病的治疗方法,也希望解决人类面临的其他重大问题,包括抗生素耐药性、微塑料污染和气候变化。如果能有对蛋白质结构的更深入理解,研究工作无疑会因此获益。蛋白质就像小巧精致的生物机器,而机器的结构决定了它的功能,因此揭示蛋白质的结构可以帮助我们理解蛋白质的功能。

AI是支持研究人员工作的强大工具,而我们相信AlphaFold是迄今为止人工智能领域提供的最强科学辅助。通过实验确定蛋白质结构是一项耗时且艰苦的工作,但AlphaFold却证明人工智能可以在几分钟内以原子级精度预测蛋白质的形状。借助AlphaFold收获对蛋白质的更深见解,为我们在生物学和医学领域取得更多新突破奠定了基础。

此次突破得益于AlphaFold团队五年来不知疲倦的探索和惊人的创造力——他们创造性地解决了大量极具难度的问题,得到了许多新的复杂算法,这些都是攻克终极难关所必需的;还得益于过去几个月与我们在一起的欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)的密切合作,我们现在才能与世界共享这宝藏。……

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