基于TCGA数据库分析PFKFB4在肝细胞癌的临床意义及分子机制

段怡平 陈梁玥 柳家翠 黄奔 程庆元 马甜甜 朱翠雯 秦菲

肝癌为常见的恶性肿瘤，以肝细胞癌（Liver hepatocellular carcinoma，LIHC）为主，肝癌病例数的增长最为迅速，且5年总体生存率（overall sur⁃vival，OS）仅为18%。对于早期肝癌患者，手术切除仍是最主要的治疗方法［1⁃2］，然而多数患者难以早期发现，且术后5年复发率高，预后较差［3］。因此，寻找新型有效的分子靶标，对改善LIHC 的预后具有重要意义。6⁃磷酸果糖⁃2⁃激酶/果糖⁃2，6⁃二磷酸酶4（6⁃phosphofructo⁃2⁃kinase⁃fructose⁃2，6⁃bisphosphatase 4，PFKFB4），其编码的蛋白质可合成果糖2，6⁃二磷酸酯（Fructose⁃2，6⁃diphosphate，F26BP），刺激糖酵解［4］。PFKFB4在多种肿瘤过表达，以满足癌细胞的生物需求。PFKFB4参与各种生物学过程，包括细胞周期、自噬和转录调控［5］，且提示抑制PFKFB4表达可能是有效的癌症治疗策略［6］。近年来，有研究证实PFKFB4与乳腺癌［7］、小细胞肺癌［8］、膀胱癌［9］、胃癌［10］进展密切相关，使患者预后较差。然而，PFKFB4在LIHC 发挥的作用和分子机理仍未阐明。本研究通过分析TCGA 数据库探讨PFKFB4在LIHC 患者中的预后价值，并预测其可能的分子机制，为LIHC 提供新的分子靶标。

1 资料与方法

1.1 数据的下载与预处理

在癌症基因组图谱（The Cancer Genome At⁃las，TCGA）数据库（https：//portal.gdc.cancer.gov/）检索并下载LIHC 的RNA 表达数据（HTSeq⁃FP⁃KM，level 3）包括374 例肿瘤样本和50 例正常样本及424 例临床数据。利用软件Strawberry Perl 5.30.1 将基因表达数据整理成基因表达矩阵用于后续分析，并删除临床特征不明确和生存时间缺失的患者数据。

1.2 PFKFB4 表达与临床病理特征和预后相关性分析

使用R 4.0.2 软件提取PFKFB4在LIHC 组织样本和正常组织样本中的mRNA 表达量数据并分析比较两组的表达水平差异，根据PFKFB4在LIHC 中的表达量中位值将患者分为高表达和低表达组。通过IBM SPSS Statistics 25.0 软件利用卡方检验分析PFKFB4表达与临床病理特征之间的相关性。……