年龄相关性听力损失核心基因的筛选及生物信息学分析

2021-03-03 01:50:54张雪宋银孙嘉伟汪海燕王宿洁黄瑾杨磊
石河子大学学报(自然科学版) 2021年6期
关键词:小鼠分析

张雪,宋银,孙嘉伟,汪海燕,王宿洁,黄瑾,杨磊,*

(1 石河子大学医学院,新疆 石河子 832000;2 杭州师范大学医学部,浙江 杭州 310036)

随着中国老龄化社会的来临,各种老年性疾病的发生也逐步增高,尤其是耳聋。据世界卫生组织报道,在65岁及以上人群,约有三分之一的人患有听力障碍[1]。在我国,老年人中听力障碍者约占80%左右[2]。老年性耳聋也称年龄相关性听力损失(ARHL),指随年龄增长而出现的双耳对称、缓慢、进行性的感音神经性听力减退,具有隐匿性及渐进性发展的特点,对患者造成严重的身体和心理危害,降低老年人的生活质量,加重社会的经济负担。

由于ARHL发病机制非常复杂,ARHL的早期诊断极其困难。为了探索其分子机制,一些学者利用基因芯片技术,用于指示其发生发展规律,研究小鼠模型ARHL发生过程中的基因表达变化[3-4]。然而,由于样本数量限制,单个微阵列测序往往表现出对高丰度分子鉴定的局限性,结果往往存在偏差[5]。利用生物信息学手段可以整合多个微阵列数据集,减少这种偏差,从而使结果更具有客观性。

本研究中,我们通过挖掘3个与ARHL有关的GEO数据集,获得了异常表达的基因,综合分析,获得与ARHL高度相关的核心基因,并通过预测其下游的信号通路及可能调控这些核心基因的miRNA,进一步明确核心基因与ARHL的相关性。

1 材料与方法

1.1 年龄相关性听力损失相关基因芯片的筛选

使用GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库以hearing loss and aging为关键词搜索基因芯片,按以下标准纳入结果:(1)研究与年龄相关性听力损失有关。……

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