3种木材DNA提取方法比较研究

余敏　魏宇创　张浩　刘盛全

摘 要：以微凹黄檀木材标本为研究对象，分别采用BATB法、PTB法和SDS法对微凹黄檀不同部位木材进行DNA提取试验，并扩增DNA条形码序列ITS2、trnH-psbA和matK，分析不同DNA提取方法对微凹黄檀木材DNA提取和DNA条形码序列扩增的影响。结果表明：采用BATB法从微凹黄檀木材心、边材组织中提取的DNA浓度以及DNA条形码扩增效率均要高于其他2种方法，说明BATB法更适合从长期存储木材中提取DNA。

关键词：微凹黄檀;DNA提取;DNA条形码;木材识别

中图分类号 S781.1 文献标识码 A文章编号 1007-7731（2021）03-0006-04

Comparison of Three Methods of DNA Extraction from Wood

YU Min et al.

（School of Forestry & Landscape Architecture， Anhui Agricultural University， Hefei 230036，China; Key Lab of State Forest and Grassland Administration on “Wood Quality Improvement & High Efficient”， Hefei 230036， China）

Abstract：The xylarium wood specimens of Dalbergia retusa were selected from the Wood Collection. Three methods， i.e.， BTAB， PTB and SDS were employed to extract DNA in sapwood and heartwood for further PCR amplification of three potential DNA barcode sequences （ITS2， trnH-psbA， and matK）. The effects of different methods on DNA extraction and PCR for target sequences were analyzed. The results showed that the concentration of DNA and efficacy of PCR using BTAB method was higher than that of PTB and SDS methods from sapwood and heartwood. The BTAB method is more suitable for extracting DNA from long-stored wood.

Key words：Dalbergia retusa Hemsl.; DNA extraction; DNA barcodes; Wood identification

相較于新鲜、幼嫩且具有分生能力的植物组织而言，从木材组织中提取和扩增DNA要困难得多，尤其是木材经过干燥和长期存储，进一步影响了DNA提取和扩增成功率[1]。随着DNA条形码技术在木材识别研究上的深入，研究人员发现从木材组织中提取足够质量和数量的DNA，是顺利应用DNA条形码技术识别和鉴定木材的基础和保证[2]。虽然已有研究报道了采用常规DNA提取方法提取木材组织DNA，但提取结果常常不能满足后续试验的需要[3]。因此，在传统的DNA提取方法基础上进一步优化木材DNA提取步骤，提高木材DNA提取效率和有效性，是长期存储木材DNA提取亟待解决的问题。为此，笔者以标本馆馆藏微凹黄檀木材标本为研究对象，分别采用BATB法、PTB法和SDS法对微凹黄檀木材进行DNA提取试验，并扩增DNA条形码序列ITS2、trnH-psbA和matK，分析不同DNA提取方法对微凹黄檀木材DNA提取和DNA条形码序列扩增的影响，探索适合长期存储木材基因组DNA提取的方法，以期为进一步开展长期存储木材DNA条形码识别研究奠定基础。……