中国人群肝功能检测指标全基因组关联分析研究

孙一丹，田子钊，周伟，李沫，怀聪，贺林，秦胜营

研究报告

中国人群肝功能检测指标全基因组关联分析研究

孙一丹，田子钊，周伟，李沫，怀聪，贺林，秦胜营

上海交通大学Bio-X研究院，上海 200030

肝功能检测(liver function test, LFTs)指标是受遗传和环境影响的复杂性状，具有个体差异性。为系统性研究中国人群全基因组范围内单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与肝功能指标之间的联系，本研究利用英国生物银行(UK Biobank)中1653名中国人的基因分型数据和表型数据为研究对象，利用PLINK软件进行全关联分析研究(genome-wide association study, GWAS)，发现229个SNP与中国人群血液中的总胆红素(total bilirubin, TB)相关，27个SNP与中国人群血液中碱性磷酸酶(alkaline phosphatase, ALP)相关，36个SNP与中国人群血液中的γ-谷氨酰转肽酶(γ-glutamyl transpeptidase, GGT)相关，1个SNP与中国人群血液中的门冬氨酸氨基转移酶(aspartate transaminase, AST)相关，最显著的位点中有11个位点是新的LFTs关联位点。通过功能基因组分析，发现这些位点的临床意义(如吉尔伯特综合征)，确定了候选基因(,,)，为从遗传角度理解中国人群LFTs的个体差异性和肝功能指标临床精准检测提供了前期研究基础。

肝功能检测；总胆红素；碱性磷酸酶；γ-谷氨酰转肽酶；全基因组关联分析

肝功能检测(liver function test, LFTs)是临床上常见的检测肝病的手段，其中血清酶活性测定在临床上被用于检测肝损伤[1]：当肝脏发生炎症或其他损伤时，肝细胞代谢异常、细胞膜的通透性改变，导致肝酶释放进入血液，因此通过检测血清中的肝酶和胆红素等指标可以评估肝脏受损程度和肝病的严重程度[2]。LFTs是检测药物性肝损伤的临床一线指标，通常也可以指示多器官复杂疾病——在心脑血管疾病，糖尿病，或代谢综合征中能观察到血清中肝酶活性的异常[3~5]。……