铁线莲属植物SSR-PCR反应体系的建立与优化

2021-03-22 03:47:50李勇慧于相丽周晓君
智慧农业导刊 2021年21期
关键词:体系优化实验

李勇慧,于相丽,周晓君

(洛阳师范学院 生命科学学院,河南 洛阳 471934)

铁线莲属(CLematis L.) 是毛茛科(Ranuncu-Laceae)植物,大约有300多种,河南省的北部、南部和西部山区是大多数铁线莲分布的地区[1]。铁线莲有较高的药用价值,如治疗风湿、肿瘤,也有利于利尿等,这就使它的经济价值也非常高[2]。另外,铁线莲属植物有许多品种,花型多种多样,颜色艳丽,再加上叶片的修饰,使铁线莲具有较高的观赏价值,在城市绿化方面被广泛使用[3-4]。简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)亦可称为微卫星(microsatellite),是目前最常用的微卫星标记之一,在真核生物的基因组编码区以及非编码区广泛地分布[5]。可以根据已知的侧翼序列设计出引物用于PCR扩增,将所需的卫星位点扩增出来,最后使用聚丙烯凝胶电泳进行跑胶,使实验结果更加直观[6]。SSR分子标记技术相比于其他技术有许多优点,如良好的多态性,稳定性好,操作时难度不大,有较强的重复性,成本低等[7-8]。同时它的应用前景非常广泛,近几年在引物筛选、植物种质资源分析等多个方面都有它的身影。

目前对铁线莲遗传多样性的研究大多围绕着细胞学和形态学这几个方面[9],少数的有关于分子方面的研究多集中在ISSR分子标记技术方面,如任夏萌等[10]利用ISSR分子标记技术对大叶铁线莲的种质遗传多样性进行了分析。但近年来SSR技术广泛应用于各种植物的遗传多样性分析中,如吴文强等人[11]用SSR技术标记藜麦基因组相对位点并进行扩增,然后用PAGE进行检测,对其遗传多样性进行分析,用同样方法的还有张佳欣等人[12]。……

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