单细胞转录组测序及其在乳腺癌中的应用

韩香臣，李小光，胡 欣

复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科，复旦大学上海医学院肿瘤学系，上海 200032

单细胞转录组测序是一项能在单细胞水平上进行无偏倚、高通量、高分辨率全转录组学分析的新技术［1］。针对肿瘤组织等异质性高的样本，传统的高通量测序技术只能提供样本中所有细胞转录水平的平均值，但单细胞转录组测序可以精准描绘样本中每个细胞的转录组特征。单细胞转录组测序技术可以帮助我们了解组织学意义相同细胞的差异，进一步探究细胞类型已知的细胞转录组特征或发现新的细胞类型［2］。

国家癌症中心2019年统计数据显示，乳腺癌占全部女性癌症的17.1%，位于中国女性癌症发病率首位，严重威胁中国女性健康［3］。有研究［4］表明，乳腺癌是一种高度异质性的肿瘤，传统的高通量测序技术不足以解决肿瘤异质性等难题。将单细胞转录组测序技术应用于乳腺癌，不仅可以解决肿瘤异质性问题，还能为阐明肿瘤微环境、转移播散、治疗耐药等问题提供新思路。

1 单细胞转录组测序技术概述

近10年来，得益于新技术的出现与实验方法的改进，单细胞转录组测序的规模呈指数增长，费用不断降低［5］。2009年，Tang等［6］运用单细胞全转录组扩增技术，将卵细胞中的mRNA无偏倚地反转录成长达3 kb的cDNA，基于二代测序SOLiD平台，首次获得了单细胞水平的转录组图谱，描绘了卵细胞中5 270个基因的转录本信息。然而，该技术只能描绘单个细胞的转录组特征，应用范围有限。……