张晓琳,邵秀丽,朱荣利,张瑞佳,郝丽英,封瑞
(中国医科大学药学院药物毒理学教研室,沈阳 110122)
长QT综合征(long QT syndrome,LQTs)是一种心律失常综合征,心电图检查具有QT间期延长、T波或U波异常等表征,临床易产生恶性心律失常[1-2]。LQTs不仅患病率较高,猝死率也很高[3]。目前,研究[4-5]已经明确LQTs与某些离子通道有关,例如L型钙通道,钠通道和钾通道。此外,许多调节通道的蛋白也被证实与LQTs的发生相关,如钙调蛋白(calmodulin,CaM)[6-8]。
心肌细胞上主要表达的钠通道为NaV1.5通道,由1个α亚基和1个或多个β亚基组成。心肌NaV1.5受细胞内CaM等多种细胞因子的调节[9-12]。CaM某些位点发生突变,导致NaV1.5的调节异常,最终可引发心脏疾病[13]。本课题组早期的研究已经成功制备出CaMD130G(第130位天冬氨酸突变为甘氨酸)突变体蛋白,但其在LQTs发病过程中与心肌NaV1.5通道的结合及调节作用仍然未知。
本研究拟采用同源建模和分子对接的方法对CaM、CaMD130G与心肌NaV1.5通道IQ基序对接,初步探索结合可能性。同时拟构建、表达、制备与纯化IQ蛋白,并初步探索其与CaMD130G的结合活性,为相关疾病的研究提供新思路。
pGEX-6P-1/GST-IQ质粒由北京擎科新业生物技术有限公司合成;胰蛋白胨和酵母提取物购自美国Oxid公司;异丙基硫代-β-D半乳糖苷(isopropylbeta-D-thiogalactopyranoside,IPTG)、二硫苏糖醇(dithiothreitol,DTT)、氨苄西林(ampicillin,Amp)、溶菌酶(lysozyme,Lys)以及N-月桂酰肌氨酸(N-lauroylsarcosine sodium,N-lau)均购自美国Sigma公司;Triton X-100和磷酸盐缓冲液(phosphate bufer,PBS)粉末购自北京Solarbio公司;Glutathione-Sepharose 4B beads(GS-4B beads)购自英国GE Healthcare 公司。
获得心肌NaV1.5通道IQ基序和CaM及其突变体CaMD130G氨基酸序列(图1),采用SWISS MODEL 数据库进行同源建模与分子对接。通过PyMOL软件读取,修饰并分析对接结果。……