钱晓涛,张媛媛
肝癌是中国第二大常见癌症,是致命的癌症之一。中国每年约有38.3万人死于肝癌,占全球肝癌死亡人数的51%,严重影响人们的健康甚至危及生命[1]。中医药在肝癌内科治疗方面有着确切的疗效,并且中医独特的理论体系和辨证论治原则可以使治疗更加个体化[2]。小柴胡汤由柴胡、黄芩、半夏、生姜、人参、大枣、甘草7味中药组成。其中柴胡、黄芩泄少阳郁热;半夏、生姜辛散,可顾护肠胃同时疏散气郁;人参、大枣益气扶正;甘草调中;全方具有和解少阳、调畅三焦气机的功效[3]。本文基于网络药理学研究方法,筛选小柴胡汤的主要活性成分及作用靶点,进一步根据网络拓扑分析筛选关键靶点,并进行GO富集分析和KEGG通路分析,有助于寻找治疗肝癌的新途径。
1.1 有效成分的筛选及靶点预测 检索中药系统药理学分析平台[4](TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php),得到柴胡、黄芩、半夏、甘草、人参、生姜、大枣的有效成分及相关靶点,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%,类药性(drug likeness,DL)≥0.18为筛选条件。
1.2 靶标蛋白基因名的确定 使用Uniprot数据库[5]中的UniProKB检索功能(https://www.uniprot.org/),查询靶标蛋白对应的基因名,并限定物种为“Homo sapiens”,将查询得到的靶点蛋白信息进行标准化。
1.3 肝癌的靶点筛选 以“liver cancer”为关键词,检索GeneCards数据库[6](https://genealacart.genecards.org/)和OMIM数据库[7](https://www.omim.org/),得到疾病相关靶点。
1.4 小柴胡汤治疗肝癌的调控网络构建 将小柴胡汤和肝癌的靶点上传至在线作图工具Venny 2.1,绘制韦恩图(见图1),得到中药药对活性成分与疾病的交集靶点,然后利用Cytoscape软件(V3.7.1)进行网络可视化,得到活性成分-交集靶点调控网络(见图2)。……